Le , La Matapédia est devenue la treizième MRC québécoise à élire son préfet au suffrage universel. Chantale Lavoie devint la première préfète élue de La Matapédia en succédant à Georges Guénard, le maire de Saint-Vianney. En effet, avant cette date, un des maires des municipalités exerçait aussi le rôle de préfet.
Les premiers habitants du territoire de la MRC furent les Micmacs, nation qui se développa vers 500 ans avant J.-C. Le premier colon canadien-français à s’établir dans la vallée fut Pierre Brochu qui s’installa à la tête du lac Matapédia en 1833 à l’endroit où se développera par la suite le village de Sayabec. Cependant, ce n’est que vers la fin du XIXe siècle que des défricheurs commencèrent à arriver plus massivement. La MRC de La Matapédia fut créée le .
Notre-Dame-du-Portage s'étend de façon linéaire sur un mince cordon riverain situé entre le fleuve Saint-Laurent et le rebord d'un plateau agricole traversé par la route Transcanadienne. Les villes importantes près de Notre-Dame-du-Portage sont Rivière-du-Loup à 12 km au nord-est, Saint-Pascal à 35 km au sud-ouest et Témiscouata-sur-le-Lac à 65 km à l'est. Notre-Dame-du-Portage est située à la hauteur de l'île aux Lièvres dans le fleuve Saint-Laurent.
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