Projet:Biologie/Bases de données suivies

Cette page se propose d'indiquer les classifications et les bases de données suivies de préférence par les différents sous-projets liés au Projet:Biologie, en fonction des ensembles de taxons traités. Pour faciliter d'une part le choix du titre et des noms redirigés, d'autre part la rédaction de la taxobox et enfin le choix des listes de sous-taxons indiquées dans l'article. On en profitera pour préciser les modèles de Catégorie:Modèle de biologie créant un lien externe utilisables pour référencer ces bases de données.

Ces choix sont généralement fait en cohérence avec le Taxobot (cf. Utilisateur:Hexasoft/Taxobot) qui sert à générer les ébauches d'articles, y compris la taxobox (le logiciel WikipediaBioReferences (WBR) n'est plus actualisé).

Le but est aussi de compléter la page d'aide Projet:Biologie/Comment trouver et traiter les noms français ou scientifiques.

BotaniqueModifier

AlguesModifier

ChampignonsModifier

À signaler : le modèle {{Mycodoc}} permet d'ajouter une référence vers la page de bibliographie d'une espèce de champignon sur le site de la Société mycologique de France (base de données Mycodoc).

PlantesModifier

Pour vérifier la validité d'un taxon de plante vasculaire (Note : le taxon peut être valide, mais plus en usage actuellement), consulter l'International Plant Names Index (IPNI). {{IPNI}}

  • Titre : en français si nom unique pour le taxon, sinon nom scientifique et redirections des noms français

Bases suivies :

et à défaut :

ZoologieModifier

  • Pour vérifier la validité des taxons de zoologie : The Official Registry of Zoological Nomenclature sur zoobank.org.

VertébrésModifier

MammalogieModifier

  • Titre : en français si nom unique pour le taxon, sinon nom scientifique et redirections des noms français
  • Classifications dans l'article : En cas de divergence, priorité accordée à Mammal Diversity Database de l'American Society of Mammalogists (ASM) car Mammal Species of the World n'est pas actualisée.
  • Modèle(s): {{MDD}}, {{MSW}}

OrnithologieModifier

Taxons modernes

ReptilesModifier

Taxons actuels sauf tortues

TortuesModifier

Taxons actuels

AmphibiensModifier

Taxons actuels

PoissonsModifier

Taxons actuels

ArthropodesModifier

AraignéesModifier

PseudoscorpionsModifier

  • Titre : en français si nom unique pour le taxon, sinon nom scientifique et redirections des noms français
  • Classification : Pseudoscorpions of the world

ScorpionsModifier

  • Titre : en français si nom unique pour le taxon, sinon nom scientifique et redirections des noms français
  • Classification : Scorpion Files

FourmisModifier

CrustacésModifier

MollusquesModifier

ÉchinodermesModifier

A signaler : les pages les plus anciennes fondent encore la phylogénie sur {{ITIS}}, mais celle-ci est obsolète de l'avis des spécialistes. Cela explique les incohérences parfois encore rencontrées entre deux pages. Dans un souci de compromis, il est possible de faire figurer dans l'article les deux phylogénies côte à côte en en précisant l'origine (comme sur l'article Oursin), et d'utiliser WoRMS dans la taxobox.

CnidairesModifier

NématodesModifier

AnnélidesModifier

BactériologieModifier

  • Classification : LPSN (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature)
  • Modèle : {{LPSN}}

VirologieModifier

  • Classification : ICTV (International Committee on Taxonomy of Viruses)
  • Modèle : {{ICTV}}

Cas de NCBIModifier

NCBI ne se déclare pas comme étant une référence en taxonomie ((en) « The NCBI taxonomy database is not an authoritative source for nomenclature or classification - please consult the relevant scientific literature for the most reliable information. ») et ce n'est de toutes façons pas son but qui est de compiler les taxons.
Il est donc inapproprié de l'utiliser comme source dans de nombreux domaines. En effet, cette base de données n'est pas gérée par des spécialistes ayant une vue d'ensemble des groupes. Si ce site peut se révéler utile dans certains cas, notamment en botanique, chaque fois que c'est possible pour constituer les listes de taxons, il faut lui préférer les sites de taxonomie de référence en leur domaine, car il est loin de faire consensus parmi nos contributeurs en biologie[2],[3],[4],[5],[6].

Voir aussiModifier

Les titres en biologieModifier

Aide en biologieModifier

  • Projet:Biologie/Aide au contributeur avec toutes les pages d'aide en biologie : comment contribuer, choix des titres, choix des noms scientifiques et français, choix des box et plusieurs articles-guides rédactionnels, de l'ébauche à l'article complet.

Notes et référencesModifier