Cytochrome P450

enzymes participant au métabolisme par le foie
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Les cytochromes P450 (CYP450) sont des hémoprotéinesprotéines ayant une molécule d'hème comme cofacteur — qui interviennent dans les réactions d'oxydoréduction d'un grand nombre de grosses ou de petites molécules, qu'il s'agisse de substrats naturels du métabolisme endogène ou de xénobiotiques (polluants, toxines, drogues, médicaments, etc.). Ce sont généralement les oxydases finales d'une chaîne de transport d'électrons. L'abréviation P450 provient de la spectrophotométrie : lorsque ces enzymes sont à l'état réduit et complexées avec le monoxyde de carbone, le pic d'absorbance se situe à une longueur d'onde de 450 nm.

Cytochrome P450
Description de cette image, également commentée ci-après
Cytochrome P450 2C9 humain (PDB 1R9O[1])
Domaine protéique
Pfam PF00067
InterPro IPR0011
PROSITE PDOC00081
SCOP 2cpp
SUPERFAMILY 2cpp
Famille OPM 41
Protéine OPM 2bdm

La réaction catalysée par les cytochromes P450 la plus courante correspond à une activité monooxygénase : un groupe hydroxyle est formé avec un atome d'oxygène provenant d'une molécule d'oxygène (O2), l'autre atome d'oxygène étant réduit en eau (H2O) à l'aide du NADPH :

RH + O2 + NADPH + H+ROH + H2O + NADP+

On connaît plus de 18 000 protéines différentes dans la famille des cytochromes P450. Ces enzymes ont été identifiées aussi bien chez des animaux que chez des plantes, des mycètes, des protistes, des bactéries, des archées et même des virus[2]. Elles n'ont cependant pas été observées chez E coli[3].

Systèmes de cytochromes P450

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La plupart des cytochromes P450 ont besoin, pour fonctionner, d'un autre cofacteur, en l'occurrence une « protéine partenaire » qui leur fournit un ou plusieurs électrons réduisant leur atome de fer, ainsi que d'une molécule de dioxygène. Ils sont classés en plusieurs systèmes en fonction de la nature des protéines impliquées dans le transfert d'électrons[4] :

Chez les vertébrés

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Les cytochromes P450 des vertébrés sont principalement exprimés dans le foie. Les composés qu'ils oxydent deviennent plus polaires et peuvent être ainsi excrétés, en particulier par les reins, dans les urines.

Typologies

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Plusieurs cytochromes P450 ont une importance particulière en médecine et en pharmacologie.

En effet, ces hémoprotéines peuvent jouer un rôle dans l'apparition de certains cancers[5].

Par ailleurs, les cytochromes participent activement à la biotransformation de nombreuses molécules exogènes (dites « xénobiotiques »), contribuant ainsi à la détoxication de l'organisme, mais aussi à celle de nombreux médicaments dans l'organisme. Plus les cytochromes P-450 sont actifs, plus les médicaments sont biotransformés rapidement. La biotransformation abolit ou réduit généralement l'activité des médicaments dont les métabolites sont pharmacologiquement inactifs. On peut aussi tirer parti des cytochromes pour transformer un médicament inactif (promédicament) en métabolite actif (comme pour la codéine avec le CYP2D6).

Les cytochromes P450 sont associés à la face cytosolique du réticulum endoplasmique lisse.

 
Structure du sous type CYP3A4 du cytochrome P450
 
Structure du sous type CYP2D6 du cytochrome P450

Il existe des centaines de cytochromes différents, répartis dans quatre familles (CYP1, CYP2, CYP3 et CYP4). On distingue également des sous-familles (CYP1A, CYP2D, etc.) et des isoenzymes distinctes (CYP3A4, CYP2D6, etc.). Chaque type de cytochrome P450 a une fonction différente. Voici quelques exemples :

Notes et références

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  1. (en) Michael R. Wester, Jason K. Yano, Guillaume A. Schoch, Christine Yang, Keith J. Griffin, C. David Stout et Eric F. Johnson, « The Structure of Human Cytochrome P450 2C9 Complexed with Flurbiprofen at 2.0-Å Resolution », Journal of Biological Chemistry, vol. 279, no 34,‎ , p. 35630-35637 (PMID 15181000, DOI 10.1074/jbc.M405427200, lire en ligne)
  2. (en) David C. Lamb, Li Lei, Andrew G. S. Warrilow, Galina I. Lepesheva, Jonathan G. L. Mullins, Michael R. Waterman et Steven L. Kelly, « The First Virally Encoded Cytochrome P450 », Journal of Virology, vol. 83, no 16,‎ , p. 8266-8269 (PMID 19515774, PMCID 2715754, DOI 10.1128/JVI.00289-09, lire en ligne)
  3. (en) P. B. Danielson, « The Cytochrome P450 Superfamily: Biochemistry, Evolution and Drug Metabolism in Humans », Current Drug Metabolism, vol. 3, no 6,‎ , p. 561-597 (PMID 12369887, DOI 10.2174/1389200023337054, lire en ligne)
  4. (en) Israel Hanukoglu, « Electron Transfer Proteins of Cytochrome P450 Systems », Advances in Molecular and Cell Biology, vol. 14,‎ , p. 29-56 (DOI 10.1016/S1569-2558(08)60339-2, lire en ligne)
  5. Guengerich FP, Kim DH, Iwasaki M (1991).Role of human cytochrome P-450 IIEI in the oxidation of many low molecular weight cancer suspects. Chem. Res. Toxicol., 1991, 4 (2), p. 168–179

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