Wikipédia

Liste d'espèces protéobacteriennes dont le génome est séquencé

liste d'un projet Wikimedia

Cette liste d'espèces protéobacteriennes dont le génome est séquencé (qui peut ne pas être à jour) présente une liste d'espèces de Proteobacteria dont le génome a été séquencé. La plupart de ces séquences ont été publiées dans des bases de données biologiques de séquences, et se trouvent en général dans la base de données publique INSDB (pour International Nucleotide Sequence Database Collaboration, en anglais), laquelle peut être consultée sur internet[1]. Les génomes ci-dessous annotés comme « non publiés » n'ont pas été publiés dans une publication scientifique à comité de lecture (mais sont généralement disponibles dans une base de données).

Delta-Epsilonproteobacteria modifier

Espèces deltaprotéobactériennes dont le génome est séquencé
Espèce Souche Type Nombre de paires de bases Nombre de gènes Référence
Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C Proteobacteria delta-epsilon 5,013,479 4,346 Non publié[1]
Bdellovibrio bacteriovorus HD100 Proteobacteria delta-epsilon 3,782,950 3,583 [2]
Campylobacter jejuni NCTC11168 Proteobacteria delta-epsilon 1,641,481 1,643 [3]
Campylobacter jejuni RM1221 Proteobacteria delta-epsilon 1,777,831 1,838 [4]
Desulfotalea psychrophila LSv54 Proteobacteria delta-epsilon 3,523,383 3,118 Non publié[1]
Desulfovibrio desulfuricans G20 Proteobacteria delta-epsilon 3,730,232 3,775 Non publié[1]
Desulfovibrio vulgaris Hildenborough Proteobacteria delta-epsilon 3,570,858 3,379 [5]
Geobacter metallireducens GS15 Proteobacteria delta-epsilon 3,997,420 3,519 Non publié[1]
Geobacter sulfurreducens PCA Proteobacteria delta-epsilon 3,814,139 3,447 [6]
Helicobacter hepaticus ATCC51449 Proteobacteria delta-epsilon 1,799,146 1,875 [7]
Helicobacter pylori 26695 Proteobacteria delta-epsilon 1,667,867 1,566 [8]
Helicobacter pylori HPAG1 Proteobacteria delta-epsilon 1,596,366 1,536 Non publié[1]
Helicobacter pylori J99 Proteobacteria delta-epsilon 1,643,831 1,491 [9]
Lawsonia intracellularis PHEMN1-00 Proteobacteria delta-epsilon 1,719,014 1,344 Non publié[1]
Non spécifié Non spécifié Proteobacteria delta-epsilon 39,794 24 Non publié[1]
Non spécifié Non spécifié Proteobacteria delta-epsilon 194,553 104 Non publié[1]
Non spécifié Non spécifié Proteobacteria delta-epsilon 1,457,619 1,187 Non publié[1]
Myxococcus xanthus DK1622 Proteobacteria delta-epsilon 9,139,763 7,331 Non publié[1]
Pelobacter carbinolicus DSM2380 Proteobacteria delta-epsilon 3,665,893 3,119 Non publié[1]
Syntrophus aciditrophicus SB Proteobacteria delta-epsilon 3,179,300 3,168 Non publié[1]
Thiomicrospira denitrificans ATCC33889 Proteobacteria delta-epsilon 2,201,561 2,097 Non publié[1]
Wolinella succino DSMZ1740 Proteobacteria delta-epsilon 2,110,355 2,044 [10]


Alphaproteobacteria modifier

Espèces alphaprotéobactériennes dont le génome est séquencé
Espèce Souche Type Nombre de paires de bases Nombre de gènes Référence
Agrobacterium tumefaciens C58 Proteobacteria Alphaproteobacteria 2,841,581 2,722 [11]
Anaplasma marginale StMaries Proteobacteria Alphaproteobacteria 1,197,687 949 [12]
Anaplasma phagocytophilum HZ Proteobacteria Alphaproteobacteria 1,471,282 1,264 [13]
Bartonella henselae Houston-1 Proteobacteria Alphaproteobacteria 1,931,047 1,612 [14]
Bartonella quintana Toulouse Proteobacteria Alphaproteobacteria 1,581,384 1,308 [14]
Bradyrhizobium japonicum USDA110 Proteobacteria Alphaproteobacteria 9,105,828 8,317 [15]
Brucella abortus 2308 (chromosome I) Proteobacteria Alphaproteobacteria 1,156,948 1,164 [16]
2308 (chromosome II) Proteobacteria Alphaproteobacteria 2,121,359 2,186 [16]
Brucella abortus 9-941 (chromosome I) Proteobacteria Alphaproteobacteria 2,124,241 2,030 [17]
9-941 (chromosome II) Proteobacteria Alphaproteobacteria 1,162,204 1,055 [17]
Brucella melitensis 16M (chromosome I) Proteobacteria Alphaproteobacteria 2,117,144 2,059 [18]
16M (chromosome II) Proteobacteria Alphaproteobacteria 1,177,787 1,139 [18]
Brucella suis 1330 (chromosome I) Proteobacteria Alphaproteobacteria 2,107,794 2,123 [19]
1330 (chromosome II) Proteobacteria Alphaproteobacteria 1,207,381 1,150 [19]
Caulobacter crescentus CB15 Proteobacteria Alphaproteobacteria 4,016,947 3,737 [20]
Ehrlichia canis Jake Proteobacteria Alphaproteobacteria 1,315,030 925 Non publié[1]
Ehrlichia chaffeensis Arkansas Proteobacteria Alphaproteobacteria 1,176,248 1,105 [13]
Ehrlichia ruminantium Gardel Proteobacteria Alphaproteobacteria 1,499,920 950 Non publié[1]
Ehrlichia ruminantium Welgevonden Proteobacteria Alphaproteobacteria 1,512,977 958 Non publié[1]
Non spécifié Non spécifié Proteobacteria Alphaproteobacteria 1,516,355 920 [21]
Erythrobacter litoralis HTCC2594 Proteobacteria Alphaproteobacteria 3,052,398 3,011 Non publié[1]
Gluconobacter oxydans 621H Proteobacteria Alphaproteobacteria 2,702,173 2,432 [22]
Jannaschia species CCS1 Proteobacteria Alphaproteobacteria 4,317,977 4,212 Non publié[1]
Magnetospirillum magneticum AMB1 Proteobacteria Alphaproteobacteria 4,967,148 4,559 [23]
Mesorhizobium loti MAFF303099 Proteobacteria Alphaproteobacteria 7,036,071 6,752 [24]
Neorickettsia sennetsu Miyayama Proteobacteria Alphaproteobacteria 859,006 932 [13]
Nitrobacter hamburgensis X14 Proteobacteria Alphaproteobacteria 4,406,967 3,804 Non publié[1]
Nitrobacter winogradskyi Nb255 Proteobacteria Alphaproteobacteria 3,402,093 3,122 Non publié[1]
Novosphingobium aromaticivorans DSM12444 Proteobacteria Alphaproteobacteria 3,561,584 3,324 Non publié[1]
Pelagibacter ubique HTCC1062 Proteobacteria Alphaproteobacteria 1,308,759 1,354 [25]
Rhizobium etli CFN42 Proteobacteria Alphaproteobacteria 4,381,608 4,067 [26]
Rhizobium leguminosarum viciae3841 Proteobacteria Alphaproteobacteria 7,751,309 4,746 Non publié[1]
Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 Proteobacteria Alphaproteobacteria 3,188,609 3,022 Non publié[1]
Non spécifié Non spécifié Proteobacteria Alphaproteobacteria 943,016 835 Non publié[1]
Rhodopseudomonas palustris BisB5 Proteobacteria Alphaproteobacteria 4,892,717 4,397 Non publié[1]
Rhodopseudomonas palustris CGA009 Proteobacteria Alphaproteobacteria 5,459,213 4,833 [27]
Rhodopseudomonas palustris HaA2 Proteobacteria Alphaproteobacteria 5,331,656 4,683 Non publié[1]
Rhodospirillum rubrum ATCC11170 Proteobacteria Alphaproteobacteria 4,352,825 3,791 Non publié[1]
Rickettsia bellii RML369-C Proteobacteria Alphaproteobacteria 1,522,076 1,429 Non publié[1]
Rickettsia conorii Malish7 Proteobacteria Alphaproteobacteria 1,268,755 1,374 [28]
Rickettsia felis URRWXCal2 Proteobacteria Alphaproteobacteria 1,485,148 1,400 [29]
Rickettsia prowazekii Madrid-E Proteobacteria Alphaproteobacteria 1,111,523 834 [30]
Rickettsia typhi Wilmington Proteobacteria Alphaproteobacteria 1,111,496 838 [31]
Rhodopseudomonas palustris BisB18 Proteobacteria Alphaproteobacteria 5,513,844 4,886 Non publié[1]
Silicibacter pomeroyi DSS3 Proteobacteria Alphaproteobacteria 4,109,442 3,810 [32]
Silicibacter species TM1040 Proteobacteria Alphaproteobacteria 3,200,938 3,030 Non publié[1]
Sinorhizobium meliloti Rm1021 Alphaproteobacteria 3,654,135 3,341 [33]
Sphingopyxis alaskensis RB2256 Proteobacteria Alphaproteobacteria 3,345,170 3,165 Non publié[1]
Wolbachia endosymbiont TRS Proteobacteria Alphaproteobacteria 1,080,084 805 [34]
Wolbachia pipientis wMel Proteobacteria Alphaproteobacteria 1,267,782 1,195 [35]
Zymomonas mobilis ZM4 Proteobacteria Alphaproteobacteria 2,056,416 1,998 [36]

Betaproteobacteria modifier

Espèces bétaprotéobactériennes dont le génome est séquencé
Espèce Souche Type Nombre de paires de bases Nombre de gènes Référence
Azoarcus sp. EbN1 Proteobacteria Betaproteobacteria 4,296,230 4,128 [37]
Bordetella bronchiseptica RB50 Proteobacteria Betaproteobacteria 5,339,179 5,006 Non publié[1]
Bordetella parapertussis 12822 Proteobacteria Betaproteobacteria 4,773,551 4,402 Non publié[1]
Bordetella pertussis TohamaI Proteobacteria Betaproteobacteria 4,086,189 3,806 Non publié[1]
Burkholderia cenocepacia AU1054 Proteobacteria Betaproteobacteria 3,294,563 2,965 Non publié[1]
Non spécifié Non spécifié Proteobacteria Betaproteobacteria 2,788,459 2,472 Non publié[1]
Non spécifié Non spécifié Proteobacteria Betaproteobacteria 1,196,094 1,040 Non publié[1]
Burkholderia mallei ATCC23344 Proteobacteria Betaproteobacteria 3,510,148 2,996 Non publié[1]
Non spécifié Non spécifié Proteobacteria Betaproteobacteria 2,325,379 2,029 [38]
Burkholderia pseudomallei 1710b Proteobacteria Betaproteobacteria 4,126,292 3,736 Non publié[1]
Non spécifié Non spécifié Proteobacteria Betaproteobacteria 3,181,762 2,611 Non publié[1]
Burkholderia pseudomallei K96243 (chromosome I) Proteobacteria Betaproteobacteria 4,074,542 3,460 [39]
K96243 (chromosome II) Proteobacteria Betaproteobacteria 3,173,005 2,395 [39]
Burkholderia species 383 Proteobacteria Betaproteobacteria 3,694,126 3,334 Non publié[1]
Non spécifié Non spécifié Proteobacteria Betaproteobacteria 3,587,082 3,174 Non publié[1]
Non spécifié Non spécifié Proteobacteria Betaproteobacteria 1,395,069 1,209 Non publié[1]
Burkholderia thailandensis E264 Proteobacteria Betaproteobacteria 3,809,201 3,276 [40]
Non spécifié Non spécifié Proteobacteria Betaproteobacteria 2,914,771 2,358 [40]
Burkholderia xenovorans LB400 Proteobacteria Betaproteobacteria 4,895,836 4,430 Non publié[1]
Non spécifié Non spécifié Proteobacteria Betaproteobacteria 3,363,523 2,960 Non publié[1]
Non spécifié Non spécifié Proteobacteria Betaproteobacteria 1,471,779 1,312 Non publié[1]
Chromobacterium violaceum ATCC12472 Proteobacteria Betaproteobacteria 4,751,080 4,407 [41]
Dechloromonas aromatica RCB Proteobacteria Betaproteobacteria 4,501,104 4,171 Non publié[1]
Methylobacillus flagellatus KT Proteobacteria Betaproteobacteria 2,971,517 2,753 Non publié[1]
Neisseria gonorrhoeae FA1090 Proteobacteria Betaproteobacteria 2,153,922 2,002 Non publié[1]
Neisseria meningitidis A Proteobacteria Betaproteobacteria 2,184,406 2,121 [42]
Neisseria meningitidis B Proteobacteria Betaproteobacteria 2,272,360 2,063 [43]
Nitrosomonas europaea Schmidt Proteobacteria Betaproteobacteria 2,812,094 2,574 [44]
Nitrosospira multiformis ATCC25196 Proteobacteria Betaproteobacteria 3,184,243 2,757 Non publié[1]
Polaromonas species JS666 Proteobacteria Betaproteobacteria 5,200,264 4,817 Non publié[1]
Ralstonia eutropha JMP134 Proteobacteria Betaproteobacteria 3,806,533 3,439 Non publié[1]
Non spécifié Non spécifié Proteobacteria Betaproteobacteria 2,726,152 2,407 Non publié[1]
Ralstonia metallidurans CH34 Proteobacteria Betaproteobacteria 3,928,089 3,601 Non publié[1]
Non spécifié Non spécifié Proteobacteria Betaproteobacteria 2,580,084 2,313 Non publié[1]
Ralstonia solanacearum GMI1000 Proteobacteria Betaproteobacteria 3,716,413 3,441 [45]
Non spécifié Non spécifié Proteobacteria Betaproteobacteria 2,094,509 1,679 [45]
Rhodoferax ferrireducens DSM15236 Proteobacteria Betaproteobacteria 4,712,337 4,170 Non publié[1]
Thiobacillus denitrificans ATCC25259 Proteobacteria Betaproteobacteria 2,909,809 2,827 Non publié[1]

Gammaproteobacteria modifier

Espèces gammaprotéobactériennes dont le génome est séquencé
Espèce Souche Type Nombre de paires de bases Nombre de gènes Référence
Acinetobacter sp. ADP1 Proteobacteria Gammaproteobacteria 3,598,621 3,325 [46]
Baumannia cicadellinicola Hc Proteobacteria Gammaproteobacteria 686,194 595 Non publié[1]
Blochmannia floridanus Strain Proteobacteria Gammaproteobacteria 705,557 589 [47]
Blochmannia pennsylvanicus bpEN Proteobacteria Gammaproteobacteria 791,654 610 [48]
Buchnera aphidicola APS Proteobacteria Gammaproteobacteria 640,681 564 [49]
Buchnera aphidicola B Proteobacteria Gammaproteobacteria 615,980 504 [50]
Buchnera aphidicola Sg Proteobacteria Gammaproteobacteria 641,454 545 [51]
Carsonella ruddii PV Proteobacteria Gammaproteobacteria 159,662 182 [52]
Chromohalobacter salexigens DSM3043 Proteobacteria Gammaproteobacteria 3,696,649 3,298 Non publié[1]
Colwellia psychrerythraea 34H Proteobacteria Gammaproteobacteria 5,373,180 4,910 Non publié[1]
Coxiella burnetii RSA493 Proteobacteria Gammaproteobacteria 1,995,281 2,016 [53]
Erwinia carotovora SCRI1043 Gammaproteobacteria 5,064,019 4,492 Non publié[1]
Escherichia coli 536 Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,938,920 4,685 Non publié[1]
Escherichia coli CFT073 Proteobacteria Gammaproteobacteria 5,231,428 5,379 [54]
Escherichia coli K-12 Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,639,675 4,331 [55]
Non spécifié Non spécifié Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,646,332 4,337 [56]
Escherichia coli O157:H7 Proteobacteria Gammaproteobacteria 5,528,445 5,349 [57]
Non spécifié Non spécifié Proteobacteria Gammaproteobacteria 5,498,450 5,361 [58]
Escherichia coli UTI89 Proteobacteria Gammaproteobacteria 5,065,741 5,066 Non publié[1]
Francisella tularensis LVS Proteobacteria Gammaproteobacteria 1,895,994 1,967 Non publié[1]
Francisella tularensis SCHUS4 Proteobacteria Gammaproteobacteria 1,892,819 1,804 [59]
Haemophilus ducreyi 3500HP Gammaproteobacteria 1,698,955 1,717 Non publié[1]
Haemophilus influenzae 86-028NP Proteobacteria Gammaproteobacteria 1,913,428 1,792 [60]
Haemophilus influenzae Rd Proteobacteria Gammaproteobacteria 1,830,138 1,709 [61]
Hahella chejuensis KCTC2396 Proteobacteria Gammaproteobacteria 7,215,267 6,782 [62]
Idiomarina loihiensis L2TR Proteobacteria Gammaproteobacteria 2,839,318 2,628 [63]
Legionella pneumophila Lens Proteobacteria Gammaproteobacteria 3,345,687 2,947 [64]
Legionella pneumophila Paris Proteobacteria Gammaproteobacteria 3,503,610 3,082 [64]
Legionella pneumophila Philadelphia1 Proteobacteria Gammaproteobacteria 3,397,754 2,942 Non publié[1]
Mannheimia succiniciproducens MBEL55E Proteobacteria Gammaproteobacteria 2,314,078 2,384 Non publié[1]
Methylococcus capsulatus Bath Proteobacteria Gammaproteobacteria 3,304,561 2,960 [65]
Nitrosococcus oceani ATCC19707 Proteobacteria Gammaproteobacteria 3,481,691 2,976 Non publié[1]
Pasteurella multocida Pm70 Proteobacteria Gammaproteobacteria 2,257,487 2,014 [66]
Photobacterium profundum SS9 Gammaproteobacteria 4,085,304 3,416 Non publié[1]
Non spécifié Non spécifié Proteobacteria Gammaproteobacteria 2,237,943 1,997 Non publié[1]
Photorhabdus luminescens laumondiiTTO1 Proteobacteria Gammaproteobacteria 5,688,987 4,905 Non publié[1]
Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125 Gammaproteobacteria 3,214,944 2,941 [67]
Non spécifié Non spécifié Proteobacteria Gammaproteobacteria 635,328 546 [67]
Pseudomonas aeruginosa PAO1 Proteobacteria Gammaproteobacteria 6,264,403 5,566 [68]
Pseudomonas entomophila L48 Proteobacteria Gammaproteobacteria 5,888,780 5,168 Non publié[1]
Pseudomonas fluorescens Pf-5 Proteobacteria Gammaproteobacteria 7,074,893 6,137 [69]
Pseudomonas fluorescens PfO-1 Proteobacteria Gammaproteobacteria 6,438,405 5,736 Non publié[1]
Pseudomonas putida KT2440 Proteobacteria Gammaproteobacteria 6,181,863 5,350 [70]
Pseudomonas syringae B728a Proteobacteria Gammaproteobacteria 6,093,698 5,136 [71]
Pseudomonas syringae DC3000 Proteobacteria Gammaproteobacteria 6,397,126 5,470 [72]
Pseudomonas syringae phaseolicola1448A Proteobacteria Gammaproteobacteria 5,928,787 4,983 Non publié[1]
Psychrobacter arcticum 273-4 Proteobacteria Gammaproteobacteria 2,650,701 2,147 Non publié[1]
Psychrobacter cryohalolentis K5 Proteobacteria Gammaproteobacteria 41,221 44 Non publié[1]
Non spécifié Non spécifié Proteobacteria Gammaproteobacteria 3,059,876 2,467 Non publié[1]
Saccharophagus degradans Feb-40 Gammaproteobacteria 5,057,531 4,008 Non publié[1]
Salmonella enterica ATCC9150 Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,585,229 4,093 [73]
Salmonella enterica SCB67 Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,755,700 4,445 [74]
Salmonella enterica Ty2 Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,791,961 4,323 [75]
Salmonella enterica typhiCT18 Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,809,037 4,600 [76]
Salmonella typhimurium LT2 Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,857,432 4,452 [77]
Shewanella denitrificans OS217 Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,545,906 3,754 Non publié[1]
Shewanella oneidensis MR1 Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,969,803 4,630 [78]
Shigella boydii Sb227 Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,519,823 4,142 [79]
Shigella dysenteriae Sd197 Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,369,232 4,277 [79]
Shigella flexneri 2457T Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,599,354 4,073 [80]
Shigella flexneri 2a301 Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,607,203 4,436 [81]
Shigella sonnei Ss046 Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,825,265 4,224 [79]
Sodalis glossinidius morsitans Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,171,146 2,432 [82]
Thiomicrospira crunogena XCL2 Proteobacteria Gammaproteobacteria 2,427,734 2,192 Non publié[1]
Vibrio cholerae N16961 (chromosome I) Gammaproteobacteria 2,961,149 2,736 [83]
N16961 (chromosome II) Proteobacteria Gammaproteobacteria 1,072,315 1,092 [83]
Vibrio fischeri ES114 (chromosome I) Proteobacteria Gammaproteobacteria 2,906,179 2,575 [84]
ES114 (chromosome II) Proteobacteria Gammaproteobacteria 1,332,022 1,172 [84]
Vibrio parahaemolyticus RIMD2210633 (chromosome I) Proteobacteria Gammaproteobacteria 3,288,558 3,080 [85]
RIMD2210633 (chromosome II) Proteobacteria Gammaproteobacteria 1,877,212 1,752 [85]
Vibrio vulnificus CMCP6 (chromosome I) Proteobacteria Gammaproteobacteria 3,281,944 2,973 [86]
CMCP6 (chromosome II) Proteobacteria Gammaproteobacteria 1,844,853 1,565 [86]
Vibrio vulnificus YJ016 (chromosome I) Proteobacteria Gammaproteobacteria 3,354,505 3,262 [87]
YJ016 (chromosome II) Proteobacteria Gammaproteobacteria 1,857,073 1,697 [87]
Wigglesworthia glossinidia Strain Proteobacteria Gammaproteobacteria 697,724 611 [88]
Xanthomonas axonopodis citri306 Gammaproteobacteria 5,175,554 4,312 [89]
Xanthomonas campestris 8004 Proteobacteria Gammaproteobacteria 5,148,708 4,273 [90]
Xanthomonas campestris 8510 Proteobacteria Gammaproteobacteria 5,178,466 4,487 [91]
Xanthomonas campestris ATCC33913 Proteobacteria Gammaproteobacteria 5,076,188 4,181 [89]
Xanthomonas oryzae KACC10331 Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,941,439 4,637 [92]
Xanthomonas oryzae MAFF311018 Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,940,217 4,372 Non publié[1]
Xylella fastidiosa 9a5c Proteobacteria Gammaproteobacteria 2,679,306 2,766 [93]
Xylella fastidiosa Temecula1 Proteobacteria Gammaproteobacteria 2,519,802 2,034 [94]
Yersinia pestis Antiqua Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,702,289 4,167 [95]
Yersinia pestis CO-92BiovarOrientalis Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,653,728 4,008 [96]
Yersinia pestis KIM Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,600,755 4,090 [97]
Yersinia pestis Mediaevalis Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,595,065 3,895 [98]
Yersinia pseudotuberculosis IP32953 Proteobacteria Gammaproteobacteria 4,744,671 3,974 [99]

Notes et références modifier

(en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « List of sequenced bacterial genomes » (voir la liste des auteurs).
  1. ↑ a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z aa ab ac ad ae af ag ah ai aj ak al am an ao ap aq ar as at au av aw ax ay az ba bb bc bd be bf bg bh bi bj bk bl bm bn bo bp bq br bs bt bu bv bw bx by bz ca cb cc et cd (en) « Entrez Genome Database Search », National Center for Biotechnology Information Search for details on specific genomes by organism name and strain.
  2. ↑ (en) Rendulic S et al., « A predator unmasked: life cycle of Bdellovibrio bacteriovorus from a genomic perspective », Science, vol. 303,‎ , p. 689–92 (PMID 14752164, DOI 10.1126/science.1093027, lire en ligne)
  3. ↑ (en) Parkhill J et al., « The genome sequence of the food-borne pathogen Campylobacter jejuni reveals hypervariable sequences », Nature, vol. 403,‎ , p. 665–8 (PMID 10688204, DOI 10.1038/35001088)
  4. ↑ (en) Fouts DE et al., « Major structural differences and novel potential virulence mechanisms from the genomes of multiple campylobacter species », PLoS Biol, vol. 3,‎ , e15 (PMID 15660156, DOI 10.1371/journal.pbio.0030015, lire en ligne)
  5. ↑ (en) Heidelberg JF et al., « The genome sequence of the anaerobic, sulfate-reducing bacterium Desulfovibrio vulgaris Hildenborough », Nat Biotechnol, vol. 22,‎ , p. 554–9 (PMID 15077118, DOI 10.1038/nbt959)
  6. ↑ (en) Methé BA et al., « Genome of Geobacter sulfurreducens: metal reduction in subsurface environments », Science, vol. 302,‎ , p. 1967–9 (PMID 14671304, DOI 10.1126/science.1088727, lire en ligne)
  7. ↑ (en) Suerbaum S et al., « The complete genome sequence of the carcinogenic bacterium Helicobacter hepaticus », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 100,‎ , p. 7901–6 (PMID 12810954, DOI 10.1073/pnas.1332093100, lire en ligne)
  8. ↑ (en) Tomb JF et al., « The complete genome sequence of the gastric pathogen Helicobacter pylori », Nature, vol. 388,‎ , p. 539–47 (PMID 9252185, DOI 10.1038/41483)
  9. ↑ (en) Alm RA et al., « Genomic-sequence comparison of two unrelated isolates of the human gastric pathogen Helicobacter pylori », Nature, vol. 397,‎ , p. 176–80 (PMID 9923682, DOI 10.1038/16495)
  10. ↑ (en) Baar C et al., « Complete genome sequence and analysis of Wolinella succinogenes », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 100,‎ , p. 11690–5 (PMID 14500908, DOI 10.1073/pnas.1932838100, lire en ligne)
  11. ↑ (en) Goodner B et al., « Genome sequence of the plant pathogen and biotechnology agent Agrobacterium tumefaciens C58 », Science, vol. 294,‎ , p. 2323–8 (PMID 11743194, DOI 10.1126/science.1066803, lire en ligne)
  12. ↑ (en) Brayton KA et al., « Complete genome sequencing of Anaplasma marginale reveals that the surface is skewed to two superfamilies of outer membrane proteins », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 102,‎ , p. 844–9 (PMID 15618402, DOI 10.1073/pnas.0406656102, lire en ligne)
  13. ↑ a b et c (en) Hotopp JC et al., « Comparative genomics of emerging human ehrlichiosis agents », PLoS Genet, vol. 2,‎ , e21 (PMID 16482227, DOI 10.1371/journal.pgen.0020021, lire en ligne)
  14. ↑ a et b (en) Alsmark CM et al., « The louse-borne human pathogen Bartonella quintana is a genomic derivative of the zoonotic agent Bartonella henselae », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 101,‎ , p. 9716–21 (PMID 15210978, DOI 10.1073/pnas.0305659101, lire en ligne)
  15. ↑ (en) Kaneko T et al., « Complete genomic sequence of nitrogen-fixing symbiotic bacterium Bradyrhizobium japonicum USDA110 », DNA Res, vol. 9,‎ , p. 189–97 (PMID 12597275, DOI 10.1093/dnares/9.6.189, lire en ligne)
  16. ↑ a et b (en) Chain PS et al., « Whole-genome analyses of speciation events in pathogenic Brucellae », Infect Immun, vol. 73,‎ , p. 8353–61 (PMID 16299333, DOI 10.1128/IAI.73.12.8353-8361.2005, lire en ligne)
  17. ↑ a et b (en) Halling SM et al., « Completion of the genome sequence of Brucella abortus and comparison to the highly similar genomes of Brucella melitensis and Brucella suis », J Bacteriol, vol. 187,‎ , p. 2715–26 (PMID 15805518, DOI 10.1128/JB.187.8.2715-2726.2005, lire en ligne)
  18. ↑ a et b (en) DelVecchio VG et al., « The genome sequence of the facultative intracellular pathogen Brucella melitensis », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 99,‎ , p. 443–8 (PMID 11756688, DOI 10.1073/pnas.221575398, lire en ligne)
  19. ↑ a et b (en) Paulsen IT et al., « The Brucella suis genome reveals fundamental similarities between animal and plant pathogens and symbionts », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 99,‎ , p. 13148–53 (PMID 12271122, DOI 10.1073/pnas.192319099, lire en ligne)
  20. ↑ (en) Nierman WC et al., « Complete genome sequence of Caulobacter crescentus », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 98,‎ , p. 4136–41 (PMID 11259647, DOI 10.1073/pnas.061029298, lire en ligne)
  21. ↑ (en) Collins NE et al., « The genome of the heartwater agent Ehrlichia ruminantium contains multiple tandem repeats of actively variable copy number », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 102,‎ , p. 838–43 (PMID 15637156, DOI 10.1073/pnas.0406633102, lire en ligne)
  22. ↑ (en) Prust C et al., « Complete genome sequence of the acetic acid bacterium Gluconobacter oxydans », Nat Biotechnol, vol. 23,‎ , p. 195–200 (PMID 15665824, DOI 10.1038/nbt1062)
  23. ↑ (en) Matsunaga T et al., « Complete genome sequence of the facultative anaerobic magnetotactic bacterium Magnetospirillum sp. strain AMB-1 », DNA Res, vol. 12,‎ , p. 157–66 (PMID 16303747, DOI 10.1093/dnares/dsi002, lire en ligne)
  24. ↑ (en) Kaneko T et al., « Complete genome structure of the nitrogen-fixing symbiotic bacterium Mesorhizobium loti », DNA Res, vol. 7,‎ , p. 331–8 (PMID 11214968, DOI 10.1093/dnares/7.6.331, lire en ligne)
  25. ↑ (en) Giovannoni SJ et al., « Genome streamlining in a cosmopolitan oceanic bacterium », Science, vol. 309,‎ , p. 1242–5 (PMID 16109880, DOI 10.1126/science.1114057, lire en ligne)
  26. ↑ (en) González V et al., « The partitioned Rhizobium etli genome: genetic and metabolic redundancy in seven interacting replicons », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 103,‎ , p. 3834–9 (PMID 16505379, DOI 10.1073/pnas.0508502103, lire en ligne)
  27. ↑ (en) Larimer FW et al., « Complete genome sequence of the metabolically versatile photosynthetic bacterium Rhodopseudomonas palustris », Nat Biotechnol, vol. 22,‎ , p. 55–61 (PMID 14704707, DOI 10.1038/nbt923)
  28. ↑ (en) Ogata H et al., « Selfish DNA in protein-coding genes of Rickettsia », Science, vol. 290,‎ , p. 347–50 (PMID 11030655, DOI 10.1126/science.290.5490.347, lire en ligne)
  29. ↑ (en) Ogata H et al., « The genome sequence of Rickettsia felis identifies the first putative conjugative plasmid in an obligate intracellular parasite », PLoS Biol, vol. 3,‎ , e248 (PMID 15984913, DOI 10.1371/journal.pbio.0030248, lire en ligne)
  30. ↑ (en) Andersson SG et al., « The genome sequence of Rickettsia prowazekii and the origin of mitochondria », Nature, vol. 396,‎ , p. 133–40 (PMID 9823893, DOI 10.1038/24094)
  31. ↑ (en) McLeod MP et al., « Complete genome sequence of Rickettsia typhi and comparison with sequences of other rickettsiae », J Bacteriol, vol. 186,‎ , p. 5842–55 (PMID 15317790, DOI 10.1128/JB.186.17.5842-5855.2004, lire en ligne)
  32. ↑ (en) Moran MA et al., « Genome sequence of Silicibacter pomeroyi reveals adaptations to the marine environment », Nature, vol. 432,‎ , p. 910–3 (PMID 15602564, DOI 10.1038/nature03170)
  33. ↑ (en) Capela D et al., « Analysis of the chromosome sequence of the legume symbiont Sinorhizobium meliloti strain 1021 », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 98,‎ , p. 9877–82 (PMID 11481430, DOI 10.1073/pnas.161294398, lire en ligne)
  34. ↑ (en) Foster J et al., « The Wolbachia genome of Brugia malayi: endosymbiont evolution within a human pathogenic nematode », PLoS Biol, vol. 3,‎ , e121 (PMID 15780005, DOI 10.1371/journal.pbio.0030121, lire en ligne)
  35. ↑ (en) Wu M et al., « Phylogenomics of the reproductive parasite Wolbachia pipientis wMel: a streamlined genome overrun by mobile genetic elements », PLoS Biol, vol. 2,‎ , E69 (PMID 15024419, DOI 10.1371/journal.pbio.0020069, lire en ligne)
  36. ↑ (en) Seo JS et al., « The genome sequence of the ethanologenic bacterium Zymomonas mobilis ZM4 », Nat Biotechnol, vol. 23,‎ , p. 63–8 (PMID 15592456, DOI 10.1038/nbt1045)
  37. ↑ (en) Rabus R et al., « Genes involved in the anaerobic degradation of ethylbenzene in a denitrifying bacterium, strain EbN1 », Arch Microbiol, vol. 178,‎ , p. 506–16 (PMID 12420173, DOI 10.1007/s00203-002-0487-2)
  38. ↑ (en) Nierman WC et al., « Structural flexibility in the Burkholderia mallei genome », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 101,‎ , p. 14246–51 (PMID 15377793, DOI 10.1073/pnas.0403306101, lire en ligne)
  39. ↑ a et b (en) Holden MT et al., « Genomic plasticity of the causative agent of melioidosis, Burkholderia pseudomallei », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 101,‎ , p. 14240–5 (PMID 15377794, DOI 10.1073/pnas.0403302101, lire en ligne)
  40. ↑ a et b BMC Genomics. 2005 Dec 7, Dec
  41. ↑ (en) Brazilian National Genome Project Consortium et al., « The complete genome sequence of Chromobacterium violaceum reveals remarkable and exploitable bacterial adaptability », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 100,‎ , p. 11660–5 (PMID 14500782, DOI 10.1073/pnas.1832124100, lire en ligne)
  42. ↑ (en) Parkhill J et al., « Complete DNA sequence of a serogroup A strain of Neisseria meningitidis Z2491 », Nature, vol. 404,‎ , p. 502–6 (PMID 10761919, DOI 10.1038/35006655)
  43. ↑ (en) Tettelin H et al., « Complete genome sequence of Neisseria meningitidis serogroup B strain MC58 », Science, vol. 287,‎ , p. 1809–15 (PMID 10710307, DOI 10.1126/science.287.5459.1809, lire en ligne)
  44. ↑ (en) Chain P et al., « Complete genome sequence of the ammonia-oxidizing bacterium and obligate chemolithoautotroph Nitrosomonas europaea », J Bacteriol, vol. 185,‎ , p. 2759–73 (PMID 12700255, DOI 10.1128/JB.185.9.2759-2773.2003, lire en ligne)
  45. ↑ a et b (en) Salanoubat M et al., « Genome sequence of the plant pathogen Ralstonia solanacearum », Nature, vol. 415,‎ , p. 497–502 (PMID 11823852, DOI 10.1038/415497a)
  46. ↑ (en) Barbe V et al., « Unique features revealed by the genome sequence of Acinetobacter sp. ADP1, a versatile and naturally transformation competent bacterium », Nucleic Acids Res, vol. 32,‎ , p. 5766–79 (PMID 15514110, DOI 10.1093/nar/gkh910, lire en ligne)
  47. ↑ (en) Gil R et al., « The genome sequence of Blochmannia floridanus: comparative analysis of reduced genomes », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 100,‎ , p. 9388–93 (PMID 12886019, DOI 10.1073/pnas.1533499100, lire en ligne)
  48. ↑ (en) Degnan PH et al., « Genome sequence of Blochmannia pennsylvanicus indicates parallel evolutionary trends among bacterial mutualists of insects », Genome Res, vol. 15,‎ , p. 1023–33 (PMID 16077009, DOI 10.1101/gr.3771305, lire en ligne)
  49. ↑ (en) Shigenobu S et al., « Genome sequence of the endocellular bacterial symbiont of aphids Buchnera sp. APS », Nature, vol. 407,‎ , p. 81–6 (PMID 10993077, DOI 10.1038/35024074)
  50. ↑ (en) van Ham RC et al., « Reductive genome evolution in Buchnera aphidicola », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 100,‎ , p. 581–6 (PMID 12522265, DOI 10.1073/pnas.0235981100, lire en ligne)
  51. ↑ (en) Tamas I et al., « 50 million years of genomic stasis in endosymbiotic bacteria », Science, vol. 296,‎ , p. 2376–9 (PMID 12089438, DOI 10.1126/science.1071278, lire en ligne)
  52. ↑ (en) Nakabachi A et al., « The 160-kilobase genome of the bacterial endosymbiont Carsonella », Science, vol. 314,‎ , p. 267 (PMID 17038615, DOI 10.1126/science.1134196, lire en ligne)
  53. ↑ (en) Seshadri R et al., « Complete genome sequence of the Q-fever pathogen Coxiella burnetii », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 100,‎ , p. 5455–60 (PMID 12704232, DOI 10.1073/pnas.0931379100, lire en ligne)
  54. ↑ (en) Welch RA et al., « Extensive mosaic structure revealed by the complete genome sequence of uropathogenic Escherichia coli », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 99,‎ , p. 17020–4 (PMID 12471157, DOI 10.1073/pnas.252529799, lire en ligne)
  55. ↑ (en) Blattner FR et al., « The complete genome sequence of Escherichia coli K-12 », Science, vol. 277,‎ , p. 1453–74 (PMID 9278503, DOI 10.1126/science.277.5331.1453, lire en ligne)
  56. ↑ (en) Riley M et al., « Escherichia coli K-12: a cooperatively developed annotation snapshot—2005 », Nucleic Acids Res, vol. 34,‎ , p. 1–9 (PMID 16397293, PMCID 1325200, DOI 10.1093/nar/gkj405)
  57. ↑ (en) Perna NT et al., « Genome sequence of enterohaemorrhagic Escherichia coli O157:H7 », Nature, vol. 409,‎ , p. 529–33 (PMID 11206551, DOI 10.1038/35054089)
  58. ↑ (en) Makino, K. et al., « Complete nucleotide sequence of the prophage VT2-Sakai carrying the verotoxin 2 genes of the enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7 derived from the Sakai outbreak », Genes and Genetic Systems, vol. 74,‎ , p. 227–39 (PMID 10734605, DOI 10.1266/ggs.74.227, lire en ligne)
  59. ↑ (en) Larsson P et al., « The complete genome sequence of Francisella tularensis, the causative agent of tularemia », Nat Genet, vol. 37,‎ , p. 153–9 (PMID 15640799, DOI 10.1038/ng1499)
  60. ↑ (en) Harrison A et al., « Genomic sequence of an otitis media isolate of nontypeable Haemophilus influenzae: comparative study with H. influenzae serotype d, strain KW20 », J Bacteriol, vol. 187,‎ , p. 4627–36 (PMID 15968074, DOI 10.1128/JB.187.13.4627-4636.2005, lire en ligne)
  61. ↑ (en) Fleischmann RD et al., « Whole-genome random sequencing and assembly of Haemophilus influenzae Rd », Science, vol. 269,‎ , p. 496–512 (PMID 7542800, DOI 10.1126/science.7542800, lire en ligne)
  62. ↑ (en) Jeong H et al., « Genomic blueprint of Hahella chejuensis, a marine microbe producing an algicidal agent », Nucleic Acids Res, vol. 33,‎ , p. 7066–73 (PMID 16352867, PMCID 1312362, DOI 10.1093/nar/gki1016)
  63. ↑ (en) Hou S et al., « Genome sequence of the deep-sea gamma-proteobacterium Idiomarina loihiensis reveals amino acid fermentation as a source of carbon and energy », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 101,‎ , p. 18036–41 (PMID 15596722, DOI 10.1073/pnas.0407638102, lire en ligne)
  64. ↑ a et b (en) Cazalet C et al., « Evidence in the Legionella pneumophila genome for exploitation of host cell functions and high genome plasticity », Nat Genet, vol. 36,‎ , p. 1165–73 (PMID 15467720, DOI 10.1038/ng1447)
  65. ↑ (en) Ward N et al., « Genomic insights into methanotrophy: the complete genome sequence of Methylococcus capsulatus (Bath) », PLoS Biol, vol. 2,‎ , e303 (PMID 15383840, DOI 10.1371/journal.pbio.0020303, lire en ligne)
  66. ↑ (en) May BJ et al., « Complete genomic sequence of Pasteurella multocida, Pm70 », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 98,‎ , p. 3460–5 (PMID 11248100, DOI 10.1073/pnas.051634598, lire en ligne)
  67. ↑ a et b (en) Médigue C et al., « Coping with cold: the genome of the versatile marine Antarctica bacterium Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125 », Genome Res, vol. 15,‎ , p. 1325–35 (PMID 16169927, DOI 10.1101/gr.4126905, lire en ligne)
  68. ↑ (en) Stover CK et al., « Complete genome sequence of Pseudomonas aeruginosa PA01, an opportunistic pathogen », Nature, vol. 406,‎ , p. 959–64 (PMID 10984043, DOI 10.1038/35023079)
  69. ↑ (en) Paulsen IT et al., « Complete genome sequence of the plant commensal Pseudomonas fluorescens Pf-5 », Nat Biotechnol, vol. 23,‎ , p. 873–8 (PMID 15980861, DOI 10.1038/nbt1110)
  70. ↑ (en) Nelson KE et al., « Complete genome sequence and comparative analysis of the metabolically versatile Pseudomonas putida KT2440 », Environ Microbiol, vol. 4,‎ , p. 799–808 (PMID 12534463, DOI 10.1046/j.1462-2920.2002.00366.x, lire en ligne)
  71. ↑ (en) Feil H et al., « Comparison of the complete genome sequences of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a and pv. tomato DC3000 », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 102,‎ , p. 11064–9 (PMID 16043691, DOI 10.1073/pnas.0504930102, lire en ligne)
  72. ↑ (en) Buell CR et al., « The complete genome sequence of the Arabidopsis and tomato pathogen Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000 », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 100,‎ , p. 10181–6 (PMID 12928499, DOI 10.1073/pnas.1731982100, lire en ligne)
  73. ↑ (en) McClelland M et al., « Comparison of genome degradation in Paratyphi A and Typhi, human-restricted serovars of Salmonella enterica that cause typhoid », Nat Genet, vol. 36,‎ , p. 1268–74 (PMID 15531882, DOI 10.1038/ng1470)
  74. ↑ (en) Chiu CH et al., « The genome sequence of Salmonella enterica serovar Choleraesuis, a highly invasive and resistant zoonotic pathogen », Nucleic Acids Res, vol. 33,‎ , p. 1690–8 (PMID 15781495, PMCID 1069006, DOI 10.1093/nar/gki297)
  75. ↑ (en) Deng W et al., « Comparative genomics of Salmonella enterica serovar Typhi strains Ty2 and CT18 », J Bacteriol, vol. 185,‎ , p. 2330–7 (PMID 12644504, DOI 10.1128/JB.185.7.2330-2337.2003, lire en ligne)
  76. ↑ (en) Parkhill J et al., « Complete genome sequence of a multiple drug resistant Salmonella enterica serovar Typhi CT18 », Nature, vol. 413,‎ , p. 848–52 (PMID 11677608, DOI 10.1038/35101607)
  77. ↑ (en) McClelland M et al., « Complete genome sequence of Salmonella enterica serovar Typhimurium LT2 », Nature, vol. 413,‎ , p. 852–6 (PMID 11677609, DOI 10.1038/35101614)
  78. ↑ (en) Heidelberg JF et al., « Genome sequence of the dissimilatory metal ion-reducing bacterium Shewanella oneidensis », Nat Biotechnol, vol. 20,‎ , p. 1118–23 (PMID 12368813, DOI 10.1038/nbt749)
  79. ↑ a b et c (en) Yang F et al., « Genome dynamics and diversity of Shigella species, the etiologic agents of bacillary dysentery », Nucleic Acids Res, vol. 33,‎ , p. 6445–58 (PMID 16275786, PMCID 1278947, DOI 10.1093/nar/gki954)
  80. ↑ (en) Wei J et al., « Complete genome sequence and comparative genomics of Shigella flexneri serotype 2a strain 2457T », Infect Immun, vol. 71,‎ , p. 2775–86 (PMID 12704152, DOI 10.1128/IAI.71.5.2775-2786.2003, lire en ligne)
  81. ↑ (en) Jin Q et al., « Genome sequence of Shigella flexneri 2a: insights into pathogenicity through comparison with genomes of Escherichia coli K12 and O157 », Nucleic Acids Res, vol. 30,‎ , p. 4432–41 (PMID 12384590, DOI 10.1093/nar/gkf566, lire en ligne)
  82. ↑ (en) Toh H et al., « Massive genome erosion and functional adaptations provide insights into the symbiotic lifestyle of Sodalis glossinidius in the tsetse host », Genome Res, vol. 16,‎ , p. 149–56 (PMID 16365377, DOI 10.1101/gr.4106106, lire en ligne)
  83. ↑ a et b (en) Heidelberg JF et al., « DNA sequence of both chromosomes of the cholera pathogen Vibrio cholerae », Nature, vol. 406,‎ , p. 477–83 (PMID 10952301, DOI 10.1038/35020000)
  84. ↑ a et b (en) Ruby EG et al., « Complete genome sequence of Vibrio fischeri: a symbiotic bacterium with pathogenic congeners », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 102,‎ , p. 3004–9 (PMID 15703294, DOI 10.1073/pnas.0409900102, lire en ligne)
  85. ↑ a et b (en) Nasu H et al., « A filamentous phage associated with recent pandemic Vibrio parahaemolyticus O3:K6 strains », J Clin Microbiol, vol. 38, no 6,‎ , p. 2156–61 (PMID 10834969, lire en ligne)
  86. ↑ a et b (en) Kim YR et al., « Characterization and pathogenic significance of Vibrio vulnificus antigens preferentially expressed in septicemic patients », Infect Immun, vol. 71,‎ , p. 5461–71 (PMID 14500463, DOI 10.1128/IAI.71.10.5461-5471.2003, lire en ligne)
  87. ↑ a et b (en) Chen CY et al., « Comparative genome analysis of Vibrio vulnificus, a marine pathogen », Genome Res, vol. 13,‎ , p. 2577–87 (PMID 14656965, DOI 10.1101/gr.1295503, lire en ligne)
  88. ↑ (en) Akman L et al., « Genome sequence of the endocellular obligate symbiont of tsetse flies, Wigglesworthia glossinidia », Nat Genet, vol. 32,‎ , p. 402–7 (PMID 12219091, DOI 10.1038/ng986)
  89. ↑ a et b (en) da Silva AC et al., « Comparison of the genomes of two Xanthomonas pathogens with differing host specificities », Nature, vol. 417,‎ , p. 459–63 (PMID 12024217, DOI 10.1038/417459a)
  90. ↑ (en) Qian W et al., « Comparative and functional genomic analyses of the pathogenicity of phytopathogen Xanthomonas campestris pv. campestris », Genome Res, vol. 15,‎ , p. 757–67 (PMID 15899963, DOI 10.1101/gr.3378705, lire en ligne)
  91. ↑ (en) Thieme F et al., « Insights into genome plasticity and pathogenicity of the plant pathogenic bacterium Xanthomonas campestris pv. vesicatoria revealed by the complete genome sequence », J Bacteriol, vol. 187,‎ , p. 7254–66 (PMID 16237009, DOI 10.1128/JB.187.21.7254-7266.2005, lire en ligne)
  92. ↑ (en) Lee BM et al., « The genome sequence of Xanthomonas oryzae pathovar oryzae KACC10331, the bacterial blight pathogen of rice », Nucleic Acids Res, vol. 33,‎ , p. 577–86 (PMID 15673718, PMCID 548351, DOI 10.1093/nar/gki206)
  93. ↑ (en) Simpson, A.J.C. et al., « The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa », Nature., vol. 406,‎ , p. 151–7 (DOI 10.1038/35018003, lire en ligne)
  94. ↑ (en) Van Sluys MA et al., « Comparative analyses of the complete genome sequences of Pierce's disease and citrus variegated chlorosis strains of Xylella fastidiosa », J Bacteriol, vol. 185,‎ , p. 1018–26 (PMID 12533478, DOI 10.1128/JB.185.3.1018-1026.2003, lire en ligne)
  95. ↑ (en) Chain PS et al., « Complete genome sequence of Yersinia pestis strains Antiqua and Nepal516: evidence of gene reduction in an emerging pathogen », J Bacteriol, vol. 188,‎ , p. 4453–63 (PMID 16740952, DOI 10.1128/JB.00124-06, lire en ligne)
  96. ↑ (en) Parkhill J et al., « Genome sequence of Yersinia pestis, the causative agent of plague », Nature, vol. 413,‎ , p. 523–7 (PMID 11586360, DOI 10.1038/35097083)
  97. ↑ (en) Deng W et al., « Genome sequence of Yersinia pestis KIM », J Bacteriol, vol. 184,‎ , p. 4601–11 (PMID 12142430, DOI 10.1128/JB.184.16.4601-4611.2002, lire en ligne)
  98. ↑ (en) Song Y et al., « Complete genome sequence of Yersinia pestis strain 91001, an isolate avirulent to humans », DNA Res, vol. 11,‎ , p. 179–97 (PMID 15368893, DOI 10.1093/dnares/11.3.179, lire en ligne)
  99. ↑ (en) Chain PS et al., « Insights into the evolution of Yersinia pestis through whole-genome comparison with Yersinia pseudotuberculosis », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 101,‎ , p. 13826–31 (PMID 15358858, DOI 10.1073/pnas.0404012101, lire en ligne)

Annexes modifier

Articles connexes modifier

Liens externes modifier

Bibliographie modifier

Ce document provient de « https://fr.wikipedia.org/w/index.php?title=Liste_d%27espèces_protéobacteriennes_dont_le_génome_est_séquencé&oldid=214783421 ».