Colwellia chukchiensis
Colwellia chukchiensis est une des espèces du genre de bactéries marines Colwellia. Ce sont des bacilles à Gram négatif de la famille des Colwelliaceae faisant partie de l'embranchement des Pseudomonadota.
| Domaine | Bacteria |
|---|---|
| Embranchement | Pseudomonadota |
| Classe | Gammaproteobacteria |
| Ordre | Alteromonadales |
| Famille | Colwelliaceae |
| Genre | Colwellia |
Historique
modifierLors de la seconde expédition du brise-glace Xue Long pour la Recherche Nationale Arctique Chinoise, des prélèvements effectués sur des sédiments à 60 m de profondeur dans la Mer de Chukchi ont permis d'isoler la souche BCw111[1]. Cette souche est la souche type de l'espèce Colwellia chukchiensis[1].
Taxonomie
modifierÉtymologie
modifierL'étymologie de cette espèce est la suivante : chuk.chi.en’sis N.L. masc./fem. adj. chukchiensis, qui vient de la Mer de Chukchi, lieu d'isolement de la souche type de cette espèce[2],[3].
Phylogénie
modifierL'analyse de la séquence nucléotidique de l'ARNr 16S de la souche BCw111 a permis de classer cette bactérie parmi différentes espèces de Colwellia. Cette souche est placée dans un clade comprenant les espèces C. polaris et C. aestuarii[2]. L'homologie de séquence la plus élevée pour ce gène l'est avec ces deux espèces avec respectivement 97,8 % et 97,1 %[2]. Ce genre bactérien est phylogénétiquement inclus dans la classe des Pseudomonadota (ex Proteobacteria)[4].
Description
modifierDescription générale
modifierColwellia chukchiensis est une bactérie à Gram négatif. L'espèce est psychrotolérante et anaérobie facultative sur gélose marine supplémentée avec du nitrate. Cette espèce est formée des bacilles incurvés d'une largeur de 0,5 µm à 1,06 µm et de 1,1 µm à 4,5 µm de long[2]. Colwellia chukchiensis est mobile par l'intermédiaire d'un flagelle polaire unique. Cette espèce est positive pour les tests catalase et oxydase[2]. Sur gélose marine, les colonies sont circulaires et convexes, non pigmentées, lisses et avec des bords bien délimités. La croissance est optimale à un température comprise entre 23 °C et 25 °C et reste possible entre 0 °C et 30 °C. Le croissance nécessite un pH de 5.0 à 10.5 (optimal entre pH 6.0 et pH 8.0) et une concentration en NaCl de 0.5 à 8.0 % (w/v). Il n'y a ucune croissance au-delà de 33°C ou sans NaCl[2]. Cette espèce ne produit pas de sulfide d'hydrogène, ni d'indole et le test Voges–Proskauer est négatif. Elle peut réduire le nitrate en azote[2]. Elle est aussi capable d'hydrolyser la caséine, la gélatine et le Tween 80[2].
Activités enzymatiques
modifierEn plus des activités enzymatiques catalase et cytochrome oxydase donnant un test positif, Colwellia chukchiensis peut aussi être caractérisée par des tests positifs pour les enzymes suivantes : Phosphatase alcaline, Estérase (C4), Estérase lipase (C8), naphthol-AS-BI-phosphohydrolase, valine arylamidase et leucine arylamidase. Par contre, elle est négative pour les tests d'activités des enzymes arginine dihydrolase, lysine décarboxylase, ornithine décarboxylase, lipase (C14), a-chymotrypsin, Phosphatase acide, trypsine, cystine aryla-midase, alpha-galactosidase, bêta-galactosidase, bêta-glucuronidase, alpha-glucosidase, N-acetyl-b-glucosaminidase, alpha-mannosidase et alpha-fucosidase[2].
Génome
modifierLors de sa description, l'espèce la plus proche est C. polaris avec laquelle l'hybridation ADN-ADN est de 42,6 %.
Habitat
modifierLa souche type de cette espèce a été isolé dans les sédiments marins à une profondeur de 60 m en Mer de de Chukchi[1].
Notes et références
modifier- Yu, Li et Zeng 2011, p. 850.
- Yu, Li et Zeng 2011, p. 852.
- (en) « Species Colwellia chukchiensis », sur LPSN,
- Xu et et al. 2017, p. 1972.
Bibliographie
modifier- (en) Yong Yu, Hui-Rong Li et Yin-Xin Zeng, « Colwellia chukchiensis sp. nov., a psychrotolerant bacterium isolated from the Arctic Ocean », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 61, no 4, , p. 850-853 (DOI 10.1099/ijs.0.022111-0)
- (en) Zhen-Xing Xu, Heng-Xi Zhang, Ji-Ru Han, Christopher A. Dunlap, Alejandro P. Rooney, Da-Shuai Mu et Zong-Jun Du, « Colwellia agarivorans sp. nov., an agar-digesting marine bacterium isolated from coastal seawater », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 67, no 6, , p. 1969-1974 (DOI 10.1099/ijsem.0.001897)
Liens externes
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- Ressources relatives au vivant :
