Phaeodactylum tricornutum

Classification
Empire	Eukaryota
Règne	Chromalveolata
Division	Stramenopiles
Sous-règne	Chromista
Division	Bacillariophyta
Sous-embr.	Diatomeae
Classe	Bacillariophyceae
Ordre	Bacillariales
Famille	Phaeodactylaceae
Genre	Phaeodactylum

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Phaeodactylum tricornutum est une diatomée marine. C'est la seule espèce du genre Phaeodactylum et l’une des espèces modèle largement utilisée pour l’étude et la caractérisation du métabolisme des diatomées. Bien qu’étant une espèce côtière on la retrouve dans de nombreux écosystèmes à travers le monde allant de la Finlande à l’équateur ^[1]. Elle peut adopter différents morphotypes (fusiforme, ovale, tri radiée)^[2]. Grâce à la disponibilité de nombreuses ressources génomiques et génétiques, elle est la diatomée la plus utilisée pour les études moléculaires ^[3]. C’est la deuxième diatomée dont le génome a été entièrement séquencé et son génome est relativement court ~27Mb ^[4]. Elle présente le réel avantage de pouvoir être transformée par différentes méthodes : transformation biolistique, électroporation et conjugaison par les bactéries. Elle est la seule diatomée connue à ce jour capable de survivre et se multiplier sans apport de silice et donc sans former de frustule ^[3].

Notes et références modifier

↑ Rastogi A, Rocha Jimenez Vieira F, Deton-Cabanillas AF, Veluchamy A, Can C, Wang G, Vanormelingen P, Bowler C, Piganeau G, Hu H and Tirichine L , 2020, A genomics approach reveals the global genetic polymorphism, structure, and functional diversity of ten accessions of the marine model diatom Phaeodactylum tricornutum, The ISME Journal 14:347–363
↑ De Martino, A; Meichenin, A; Shi, J; Pan, KH; Bowler, C (2007). "Genetic and phenotypic characterization of Phaeodactylum tricornutum (Bacillariophyceae) accessions". Journal of Phycology. 43 (5): 992–1009. doi:10.1111/j.1529-8817.2007.00384.x.
↑ ^{a et b} Falciatore A, Jaubert M, Bouly JP, Bailleul B and Mockc T, 2020, Diatom Molecular Research Comes of Age: Model Species for Studying Phytoplankton Biology and Diversity, The Plant Cell, Vol. 32: 547–572
↑ Bowler, C. & al, 2008, The Phaeodactylum genome reveals the dynamic nature and multi-lineage evolutionary history of diatom genomes. Nature, 456(7219), pp. 239- 244.

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[1] Rastogi A, Rocha Jimenez Vieira F, Deton-Cabanillas AF, Veluchamy A, Can C, Wang G, Vanormelingen P, Bowler C, Piganeau G, Hu H and Tirichine L , 2020, A genomics approach reveals the global genetic polymorphism, structure, and functional diversity of ten accessions of the marine model diatom Phaeodactylum tricornutum, The ISME Journal 14:347–363

[2] De Martino, A; Meichenin, A; Shi, J; Pan, KH; Bowler, C (2007). "Genetic and phenotypic characterization of Phaeodactylum tricornutum (Bacillariophyceae) accessions". Journal of Phycology. 43 (5): 992–1009. doi:10.1111/j.1529-8817.2007.00384.x.

[Falciatore_et_al.-3] {a et b} Falciatore A, Jaubert M, Bouly JP, Bailleul B and Mockc T, 2020, Diatom Molecular Research Comes of Age: Model Species for Studying Phytoplankton Biology and Diversity, The Plant Cell, Vol. 32: 547–572

[4] Bowler, C. & al, 2008, The Phaeodactylum genome reveals the dynamic nature and multi-lineage evolutionary history of diatom genomes. Nature, 456(7219), pp. 239- 244.

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