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Janet Thornton

bio informaticienne britannique
Janet Thornton
Biographie
Naissance
Voir et modifier les données sur Wikidata (74 ans)
Nationalité
Formation
Bury Grammar School Girls (en) (jusqu'en )
Université de Nottingham
King's College de Londres
National Institute for Medical Research (en)Voir et modifier les données sur Wikidata
Activité
Autres informations
A travaillé pour
Membre de
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Distinctions
Liste détaillée
Commandeur de l'ordre de l'Empire britannique ()
ISCB Senior Scientist Award ()
Docteur honoris causa de l'université du Kent ()
Dorothy Crowfoot Hodgkin Award (d) ()
ISCB Fellow ()
Dame commandeur de l'ordre de l'Empire britannique ()
Membre de l'Academy of Medical Sciences (en) ()
Membre de l'EMBO
Fellow of the Royal Society of Chemistry
Honorary member of the British Biophysical Society (d)Voir et modifier les données sur Wikidata

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Janet Maureen Thornton (née le ) est une scientifique britannique, directrice émérite de l'Institut européen de bio-informatique (EBI), qui fait partie du Laboratoire européen de biologie moléculaire (EMBL)[1],[2]. Elle est l'une des plus grandes chercheuses en Bio-informatique structurale, utilisant des méthodes informatiques pour comprendre la structure et la fonction des protéines[3],[4],[5]. Elle est directrice de l'EBI d'octobre 2001 à juin 2015 et joue un rôle clé dans ELIXIR[6].

Éducation modifier

Janet Thornton fréquente la Bury Grammar School jusqu'en 1967, où elle est préfète en chef[7]. Après avoir obtenu son diplôme en physique à l'Université de Nottingham, Thornton obtient une maîtrise en biophysique au King's College de Londres et un doctorat en biophysique à l'Institut national de recherche médicale de Mill Hill, Londres en 1973.

Carrière et recherche modifier

Après son doctorat, Thornton travaille en biophysique moléculaire avec David Chilton Phillips à l'Université d'Oxford[8],[9]. En 1978, elle retourne à l'Institut national de recherche médicale, puis obtient une bourse au Birkbeck College, qui fait partie de l'Université de Londres. En 1990, elle est nommée professeur et directrice de l'unité de structure et de modélisation biomoléculaires au département de biochimie et de biologie moléculaire de l'University College de Londres, puis est également nommée à la chaire Bernal du département de cristallographie du Birkbeck College.

Thornton est directrice de l'Institut européen de bioinformatique (EBI) de 2001 à 2015, sur le Wellcome Genome Campus à Hinxton près de Cambridge[10]. Elle est organisatrice de la conférence conjointe sur les systèmes intelligents pour la biologie moléculaire (ISMB) et la Conférence européenne sur la biologie computationnelle (ECCB) à Glasgow en 2004[11].

Le travail de Thornton est hautement interdisciplinaire et s'interface entre autres avec la biologie structurale, la bioinformatique, la chimie biologique et la chimioinformatique. Elle est l'une des pionnières de la validation de structure pour la cristallographie des protéines, en développant le logiciel ProCheck, largement utilisé[12]. Avec Christine Orengo, elle introduit la classification CATH[13] de la structure des protéines[14],[15],[16],[17],[18],[19],[20]. Son groupe développe un outil robuste de classification, de comparaison et d'annotation des enzymes - l'EC-BLAST [21] qui calcule la similarité entre les enzymes sur la base de réactions chimiques en capturant le(s) changement(s) de liaison, le(s) centre(s) de réaction ou la similarité structurelle entre eux[22],[21].

De 2008 à 2012, elle coordonne la phase préparatoire de quatre ans de l'infrastructure européenne de données sur les sciences de la vie ELIXIR[6]. Depuis 2013, elle reste membre du conseil d'administration d'ELIXIR en tant que déléguée scientifique de l'EMBL[23].

Thornton est élue membre de la Royal Society (FRS) en 1999[24]. Elle devient membre de l'Organisation européenne de biologie moléculaire (EMBO) en 2000[25], associée étrangère de l'Académie nationale des sciences des États-Unis en 2003 et membre de l'Académie des sciences médicales (FMedSci) en 2014. Thornton est membre surnuméraire du Churchill College de Cambridge[26]. Elle est élue Fellow de la Royal Society of Chemistry (FRSC) en 2017[27].

Thornton est nommée Commandeur de l'Ordre de l'Empire britannique (CBE) en 2000 et Dame Commandeur de l'Ordre de l'Empire britannique (DBE) lors des honneurs d'anniversaire de 2012 pour services rendus à la bioinformatique. Le Times désigne Thornton numéro 86 de son « Eureka 100 » des scientifiques britanniques en 2010[28]. Elle reçoit le prix Suffrage Science en 2011.

Références modifier

  1. ↑ « Professor Dame Janet Thornton: Director, European Bioinformatics Institute » [archive du ]
  2. ↑ « Great British bioscience pioneers – Professor Dame Janet Thornton » [archive du ]
  3. ↑ Zagorski, « Profile of Janet M. Thornton », Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 102, no 35,‎ , p. 12296–12298 (PMID 16118281, PMCID 1194944, DOI 10.1073/pnas.0505819102, Bibcode 2005PNAS..10212296Z)  
  4. ↑ Dean, Osborn, Oshlack et Thornton, « Women in Science », Genome Biology, vol. 13, no 3,‎ , p. 148–201 (PMID 22405408, PMCID 3439960, DOI 10.1186/gb4005)
  5. ↑ « Thornton Research Group Page » [archive du ]
  6. ↑ a et b Crosswell et Thornton, « ELIXIR: A distributed infrastructure for European biological data », Trends in Biotechnology, vol. 30, no 5,‎ , p. 241–242 (PMID 22417641, DOI 10.1016/j.tibtech.2012.02.002)
  7. ↑ (en) David Thomson, « Top scientist tells Bury Grammar School pupils: 'follow your dreams' », Bury Times,‎ (lire en ligne)
  8. ↑ Thornton et Bayley, « Conformational energy calculations for dinucleotide molecules. A systematic study of dinucleotide conformation, with application to diadenosine pyrophosphate », Biopolymers, vol. 15, no 5,‎ , p. 955–975 (PMID 177120, DOI 10.1002/bip.1976.360150511, S2CID 30211950)
  9. ↑ Perkins, Piper et Thornton, « Computer techniques for conformational studies of biological molecules », Computers in Biology and Medicine, vol. 6, no 1,‎ , p. 23–31 (PMID 1253578, DOI 10.1016/0010-4825(76)90034-2)
  10. ↑ « Janet Thornton steps down » [archive du ], European Bioinformatics Institute,
  11. ↑ « ISMB/ECCB 2004 », www.iscb.org
  12. ↑ Laskowski, MacArthur, Moss et Thornton, « PROCHECK: A program to check the stereochemical quality of protein structures », Journal of Applied Crystallography, vol. 26, no 2,‎ , p. 283–291 (DOI 10.1107/S0021889892009944, Bibcode 1993JApCr..26..283L)
  13. ↑ Orengo, Michie, Jones et Jones, « CATH – a hierarchic classification of protein domain structures », Structure, vol. 5, no 8,‎ , p. 1093–1109 (PMID 9309224, DOI 10.1016/S0969-2126(97)00260-8)
  14. ↑ Marx, « The Author File: Janet Thornton », Nature Methods, vol. 11, no 2,‎ , p. 115 (PMID 24645189, DOI 10.1038/nmeth.2831, S2CID 1970327)
  15. ↑ Sibanda, Blundell et Thornton, « Conformation of beta-hairpins in protein structures. A systematic classification with applications to modelling by homology, electron density fitting and protein engineering », Journal of Molecular Biology, vol. 206, no 4,‎ , p. 759–77 (PMID 2500530, DOI 10.1016/0022-2836(89)90583-4)
  16. ↑ Thornton, Singh, Campbell et Blundell, « Protein-protein recognition via side-chain interactions », Biochemical Society Transactions, vol. 16, no 6,‎ , p. 927–30 (PMID 3224756, DOI 10.1042/bst0160927)
  17. ↑ Blundell, Sibanda, Sternberg et Thornton, « Knowledge-based prediction of protein structures and the design of novel molecules », Nature, vol. 326, no 6111,‎ , p. 347–52 (PMID 3550471, DOI 10.1038/326347a0, Bibcode 1987Natur.326..347B, S2CID 4330510)
  18. ↑ Blundell, Barlow, Borkakoti et Thornton, « Solvent-induced distortions and the curvature of alpha-helices », Nature, vol. 306, no 5940,‎ , p. 281–3 (PMID 6646210, DOI 10.1038/306281a0, Bibcode 1983Natur.306..281B, S2CID 4331613)
  19. ↑ Reeves, Eilbeck, Magrane et O'Donovan, « The Protein Feature Ontology: A tool for the unification of protein feature annotations », Bioinformatics, vol. 24, no 23,‎ , p. 2767–2772 (PMID 18936051, PMCID 2912506, DOI 10.1093/bioinformatics/btn528)
  20. ↑ Rahman, Cuesta, Furnham et Holliday, « EC-BLAST: A tool to automatically search and compare enzyme reactions », Nature Methods, vol. 11, no 2,‎ , p. 171–4 (PMID 24412978, PMCID 4122987, DOI 10.1038/nmeth.2803)
  21. ↑ a et b (en) Rahman, Cuesta, Furnham et Holliday, « EC-BLAST: a tool to automatically search and compare enzyme reactions », Nature Methods, vol. 11, no 2,‎ , p. 171–174 (ISSN 1548-7091, PMID 24412978, PMCID 4122987, DOI 10.1038/nmeth.2803)
  22. ↑ Rahman, Torrance, Baldacci et Martínez Cuesta, « Reaction Decoder Tool (RDT): extracting features from chemical reactions », Bioinformatics, vol. 32, no 13,‎ , p. 2065–2066 (ISSN 1367-4811, PMID 27153692, PMCID 4920114, DOI 10.1093/bioinformatics/btw096)
  23. ↑ « ELIXIR's leadership: Governance in ELIXIR's construction phase » [archive du ]
  24. ↑ « Why Prof. Thornton was awarded the FRS » [archive du ], London, Royal Society
  25. ↑ Anon, « The EMBO Pocket Directory » [archive du ], European Molecular Biology Organization,
  26. ↑ « Professor Dame Janet Thornton PhD, CBE, FRS, DBE, Churchill College, Cambridge » [archive du ]
  27. ↑ « Our Honorary Fellows », Royal Society of Chemistry (consulté le )
  28. ↑ « Eureka 100: the people that matter », The Times, London,‎ (lire en ligne)

Liens externes modifier

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