Colwellia beringensis

espèce de bactérie

Colwellia beringensis est une des espèces du genre de bactéries marines Colwellia. Ce sont des bacilles à Gram négatif de la famille des Colwelliaceae faisant partie de l'embranchement des Pseudomonadota.

Colwellia beringensis
Description de l'image Defaut 2.svg.
Classification LPSN
Domaine Bacteria
Embranchement Pseudomonadota
Classe Gammaproteobacteria
Ordre Alteromonadales
Famille Colwelliaceae
Genre Colwellia

Espèce

Colwellia beringensis
Zhang et al. 2017[1]
souche type NB097-1 (KCTC 52554; MCCC 1A11668)

Historique

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Lors de la sixième expédition de la Recherche Nationale Arctique Chinoise du brise-glace Xue Long, des prélèvements de sédiments marins ont été effectués en mer de Bering. Ceux-ci ont permis l'isolement de la souche bactérienne NB097-1 qui est devenue ensuite la souche type de la nouvelle espèce Colwellia beringensis[1]. Cette espèce été décrite la même année que l'espèce Colwellia agarivorans[2].

Taxonomie

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Étymologie

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L'étymologie de cette espèce Colwellia beringensis est la suivante : be.ring.en’sis N.L. masc./fem. adj. beringensis, qui fait référence à la mer de Bering où a été isolée la souche type de cette espèce[3],[4].

Phylogénie

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Le génome complet de la souche NB097-1 a été séquencé sous le numéro d'accession CP02046[5]. De cette séquence génomique, l'analyse phylogénique de la séquence nucléotidique de l'ARNr 16S laquelle a permis de classer cette bactérie parmi les différentes espèces de Colwellia. Cette souche se retrouve parmi un groupe formé des espèces Colwellia sediminilitoris, C. mytili, C. aestuarii, C. polaris et C. chukchiensis[6]. La présence de C. beringensis au sein du genre Colwellia la classe dans le phylum Pseudomonadota (ex Proteobacteria).

Description

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Colwellia beringensis est une espèce aérobie psychrophile à Gram négatif. Cette espèce est formée des bacilles positifs pour les tests catalase et oxydase[3].

Habitat

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Cette espèce fait partie des bactéries marines[1].

Notes et références

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  1. a b et c Zhang et et al. 2017, p. 5102.
  2. Xu et et al. 2017, p. 1972.
  3. a et b Zhang et et al. 2017, p. 5106.
  4. (en) « Species Colwellia beringensis », sur LPSN,
  5. Zhang et et al. 2017, p. 5103.
  6. Zhang et et al. 2017, p. 5104.

Bibliographie

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  • (en) Cong Zhang, Wenbin Guo, Yuguang Wang et Xinhua Chen, « Colwellia beringensis sp. nov., a psychrophilic bacterium isolated from the Bering Sea », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 67, no 12,‎ , p. 5102-5107 (DOI 10.1099/ijsem.0.002423)
  • (en) Zhen-Xing Xu, Heng-Xi Zhang, Ji-Ru Han, Christopher A. Dunlap, Alejandro P. Rooney, Da-Shuai Mu et Zong-Jun Du, « Colwellia agarivorans sp. nov., an agar-digesting marine bacterium isolated from coastal seawater », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 67, no 6,‎ , p. 1969-1974 (DOI 10.1099/ijsem.0.001897)

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