Séquence cis

Une séquence cis est une séquence d'ADN capable de moduler l'expression d'un gène présent (en général) sur le même chromosome.

La notion de séquence cis s'oppose à celle de facteur trans qui désigne quant à elle les facteurs de transcription agissant sur ces séquences cis.

DécouverteModifier

Historiquement, la définition des facteurs cis est expérimentale : un facteur agit en cis si l'on ne peut pas le transcomplémenter, c'est-à-dire que l'on n'obtient pas l'effet de modulation si on transfecte un plasmide contenant la séquence correspondante associé à un promoteur dans la cellule.

Eléments cis-régulateurModifier

Définition généraleModifier

  • Séquences inférieures à 20 nucléotides ;
  • le plus souvent situé en amont du site d'initiation (sauf exception : régulation en amont du gène dans la région 5'UTR, c’est-à-dire’ dans la région promotrice du gène) ;
  • certaines de ces séquences confèrent une spécificité tissulaire d'expression aux gènes qui les possèdent ;
  • d'autres sont la cible de facteur transcriptionnels (facteur trans) dont la fixation ou l'activation est sous contrôle de stimuli intra ou exta cellulaires (comme les hormones par exemple).

Différentes régions cisModifier

Il existe deux types de séquences CIS agissant dans la régulation des gènes :

  • Les séquences cis régulatrices à position parfaitement définie
  • Les séquences cis régulatrices à localisation variable

Séquences à position parfaitement définieModifier

Séquences à localisation variableModifier

  • Souvent très éloignées du gène : en amont/aval/dans les introns ou sur un autre brin de l'ADN.

Comprend deux types particuliers :

  • Séquence stimulatrice = enhancers, qui permettent l'activation de certains gènes dans des tissus particuliers.
  • Séquence inhibitrice = silencers, impliquée dans la répression des gènes.