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Ferdinand Berthoud, né le à Plancemont-sur-Couvet (canton de Neuchâtel) et mort à Groslay le , est un horloger suisse.
Berthoud vint se fixer à Paris en 1745. On admet généralement qu’il entre alors à l’atelier de Julien Le Roy. Ferdinand Berthoud acquit rapidement une réputation de compétence technique et fut reconnu pour ses innovations dans le domaine de l'horlogerie.
Il y fit les premières horloges marines destinées à faire connaître la longitude en mer et en reconnaissance fut choisi en tant qu'horloger-mécanicien de la marine. En 1764, sur ordre du Roi, l'Académie chargea deux de ses membres, Duhamel du Monceau et l'abbé Chappe d'Auteroche, de faire la preuve en mer de la montre marine no 3 de Ferdinand Berthoud. Ils embarquèrent, en compagnie de Ferdinand Berthoud, à Brest le 7 octobre sur la corvette L'Hirondelle. Le rapport de la mission, lu par l'abbé Chappe d'Auteroche à l'Académie le 14 novembre, ne sera jamais publié ce qui est exceptionnel. Dans son Traité des horloges marines, Berthoud insinue que cet oubli est le fait de Duhamel du Monceau dont le neveu, Fougeroux de Grandlieu, alors enseigne de vaisseau lors de cette croisière, est mort quelques jours après le retour.
Ferdinand Berthoud est nommé Horloger du roi dès 1773. Il fut nommé dès la création membre de l’Institut (1795). Berthoud est devenu membre de la Royal Society le 16 février 1764.
Il est considéré comme l’inventeur de l’horloge marine qui permet la détermination de la longitude en mer, et qui a beaucoup servi au perfectionnement de la géographie.