Modèle:Infobox Protéine

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Ce modèle permet la mise en place d'une infoboîte modulaire sur les pages consacrées à une protéine ou à une enzyme particulière. Il est à utiliser conjointement avec {{Infobox Protéine/Caractéristiques espèces}}, ces deux modèles devant être encadrés par {{Infobox/Début}} et {{Infobox/Fin}}.

Syntaxe

Les champs à compléter pour cette infoboîte sont les suivants :

{{Infobox/Début}}
{{Infobox Protéine
 | nom                 = 
 | nom approuvé        = 
 | image               = 
 | image-taille        = 
 | légende             = 
 | alternative         = 
 | symbole             = 
 | synonymes           = 
 | fonction            = 
 | distribution        = 
 | localisation        = 
 | N°_EC               = 
 | DrugBank            = 
 | ATC_liste           = {{ATC|}}
 | PDB_liste           = {{PDB2|}}
}}
{{Infobox Protéine/Caractéristiques espèces
 | nom espèce          = 
  [...]
}}
{{Infobox/Fin}}

Paramètres

Cette infoboîte permet d'indiquer les données générales d'une protéine. Les données relatives à une sous-unité ou à un peptide exprimé à partir d'un gène précis chez une espèce données sont à indiquer à l'aide de l'infoboîte « Infobox Protéine/Caractéristiques espèces ».

Paramètres du modèle[Modifier les données du modèle]

Paramètre		Description	Type	État
Nom	nom	Nom de la protéine	Chaîne	facultatif
Nom approuvé	nom approuvé	Nom retenu dans les bases de données, idéalement issu d'UniProt	Chaîne	facultatif
Image	image	Illustration de la protéine ou d'un de ses domaines	Chaîne	facultatif
Taille de l'image	image-taille	Permet d'ajuster la taille de l'image en spécifiant le nombre de pixels. 280 correspond à la largeur maximum dans l'infoboîte.	Chaîne	facultatif
Légende de l'image	légende	Description de l'illustration, idéalement avec sa source.	Chaîne	facultatif
Symbole	symbole	Symbole HUGO pour les protéines humaines, nom du gène principal dans le cas général	Chaîne	facultatif
Synonymes	synonymes	Noms et symboles alternatifs de la protéine. Ils peuvent être très nombreux, aussi convient-il de se limiter aux plus courants afin d'éviter de surcharger l'infoboîte d'informations peu pertinentes.	Chaîne	facultatif
N° EC	N°_EC	Numéros EC de chacune des activités enzymatiques de la protéine, séparés par le signe « + ». Exemple 6.3.5.5+2.1.3.2+3.5.2.3	Chaîne	facultatif
DrugBank	DrugBank	Identifiant de la protéine dans la base de données DrugBank. Exemple DB00030	Chaîne	facultatif
Liste des codes ATC	ATC_liste	Liste des codes ATC, entrés à l'aide du modèle {{ATC|}}. Exemple {{ATC|A10AB01}}	Chaîne	facultatif
Liste de structures PDB	PDB_liste	Liste de structures PDB, entrées à l'aide du modèle {{PDB2|}}. Ces structures peuvent être très nombreuses (plusieurs dizaines, voire centaines), auquel cas il est préférable de les indiquer dans l'infoboîte « Infobox Protéine/Caractéristiques espèces » en mode compact (avec boîte déroulante).	Chaîne	facultatif
Fonction	fonction	Fonctions biochimiques et physiologiques de la protéine	Chaîne	facultatif
Distribution	distribution	Distribution de la protéine entre les différents tissus.	Chaîne	facultatif
Localisation	localisation	Localisation de la protéine entre les différents compartiments cellulaires au sein des cellules.	Chaîne	facultatif
Chromosome	chromosome	(paramètre obsolète) Chromosome humain portant le gène codant la la protéine. Cette information est mieux indiquée dans l'infoboîte « Infobox Protéine/Caractéristiques espèces », qui permet de détailler chaque gène pour une espèce donnée.	Chaîne	facultatif
Bras	bras	(paramètre obsolète) Bras p ou q du chromosome humain portant le gène codant la protéine. Cette information est mieux indiquée dans l'infoboîte « Infobox Protéine/Caractéristiques espèces », qui permet de détailler chaque gène pour une espèce donnée.	Chaîne	facultatif
Bande	bande	(paramètre obsolète) Bande chromosomique portant le gène codant la protéine. Cette information est mieux indiquée dans l'infoboîte « Infobox Protéine/Caractéristiques espèces », qui permet de détailler chaque gène pour une espèce donnée.	Chaîne	facultatif

Exemple

Protéine trifonctionnelle CAD
Domaine dihydroorotase de la protéine CAD humaine (PDB 4C6C)
Caractéristiques générales
Nom approuvé	Carbamyl-phosphate synthase II / Aspartate carbamoyltransférase / Dihydroorotase
Symbole	CAD
N° EC	6.3.5.5+2.1.3.2+3.5.2.3
Homo sapiens
Locus	2p23.3
Masse moléculaire	242 984 Da
Nombre de résidus	2 225 acides aminés
Liens accessibles depuis GeneCards et HUGO.
Entrez 790 HUGO 1424 OMIM 114010 UniProt P27708 RefSeq (ARNm) NM_001306079.1, NM_004341.4 RefSeq (protéine) NP_001293008.1, NP_004332.2 Ensembl ENSG00000084774 PDB 4BY3, 4C6B, 4C6C, 4C6D, 4C6E, 4C6F, 4C6I, 4C6J, 4C6K, 4C6L, 4C6M, 4C6N, 4C6O, 4C6P, 4C6Q GENATLAS • GeneTests • GoPubmed • HCOP • H-InvDB • Treefam • Vega

{{Infobox/Début}}
{{Infobox Protéine
 | nom                 = Protéine trifonctionnelle CAD
 | nom approuvé        = Carbamyl-phosphate synthase II / Aspartate carbamoyltransférase / Dihydroorotase
 | image               = 4c6c.png
 | image-taille        = 270
 | légende             = Domaine [[dihydroorotase]] de la protéine CAD humaine ({{PDB|4C6C}})
 | alternative         = à renseigner
 | symbole             = CAD
 | synonymes           = 
 | fonction            = 
 | distribution        = 
 | N°_EC               = 6.3.5.5+2.1.3.2+3.5.2.3
 | DrugBank            = 
 | ATC_liste           = {{ATC|}}
 | PDB_liste           = {{PDB2|}}
}}
{{Infobox Protéine/Caractéristiques espèces
 | nom espèce          = Homo sapiens
 | chromosome          = 2
 | bras                = p
 | bande               = 23.3
 | fin_de_locus        = 
 | localisation        = 
 | point isoélectrique = 
 | masse_en_daltons    = 242984
 | nbre_de_residus     = 2225
 | AltSymbols          = 
 | mise_en_boite       = oui
 | DrugBank            = 
 | EntrezGene          = 790
 | HGNCid              = 1424
 | OMIM                = 114010
 | UniProt             = P27708
 | RefSeq_ARNm         = {{RefSeq|NM_001306079.1}}, {{RefSeq|NM_004341.4}}
 | RefSeq_prot         = {{RefSeq|NP_001293008.1}}, {{RefSeq|NP_004332.2}}
 | Ensembl             = ENSG00000084774
 | PDB_liste           = {{PDB2|4BY3}}, {{PDB2|4C6B}}, {{PDB2|4C6C}}, {{PDB2|4C6D}}, {{PDB2|4C6E}}, {{PDB2|4C6F}}, {{PDB2|4C6I}}, {{PDB2|4C6J}}, {{PDB2|4C6K}}, {{PDB2|4C6L}}, {{PDB2|4C6M}}, {{PDB2|4C6N}}, {{PDB2|4C6O}}, {{PDB2|4C6P}}, {{PDB2|4C6Q}}
 | symbole             = CAD
 | hugo                = 1424
}}
{{Infobox/Fin}}

Module complémentaire

• {{Infobox Protéine/Caractéristiques espèces}}

Voir aussi

• Tutoriel infobox modulaire

Références

La documentation de ce modèle est générée par le modèle {{Documentation}}.
Elle est incluse depuis sa sous-page de documentation. Veuillez placer les catégories sur cette page-là.
Les éditeurs peuvent travailler dans le bac à sable (créer) et la page de test (créer).
Voir les statistiques d'utilisation du modèle sur l'outil wstat.