Métatranscriptomique
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La métatranscriptomique est à la transcriptomique ce que la métagénomique est à la génomique. Si la transcriptomique est l'étude du transcriptome, c'est-à-dire l'étude de l'ensemble des ARN issus de la transcription du génome d'un organisme, la métatranscriptomique a pour but l'étude de l'ensemble des ARN issus de la transcription des génomes de l'ensemble des organismes faisant partie d'un milieu. En raison des difficultés techniques (la demi-vie courte de l'ARNm, par exemple) dans la collecte de l'ARN lié à un environnement, il y a eu relativement peu d'études metatranscriptomiques in situ sur les communautés microbiennes à ce jour[1]. Les travaux d'échantillonnage de la mission Tara Oceans avec l'expédition 2009 - 2012, constitue l'un des premiers exemples de travaux de recherche de métaséquençage en milieu marin où ont été menées des recherches non seulement en métagénomique mais aussi en métatranscriptomique[2].
Notes et références modifier
- (en) C. Simon et R. Daniel, « Metagenomic Analyses: Past and Future Trends », Applied and Environmental Microbiology, vol. 77, no 4, , p. 1153–1161 (PMID 21169428, PMCID 3067235, DOI 10.1128/AEM.02345-10)
- Pour la science, nov. 2016, p.71, entretien avec Éric Karsenti
