Dans son ensemble, le jeu est bien accueilli par la presse spécialisée. Le Gaming Entertainment Monthly explique que « Microsoft Baseball 2000 est comme un rendez-vous, il y a tout ce qu'on peut désirer : les bonnes sensations, les conversations, et du bon temps, mais on ne sait pas pourquoi, on ne "sent" pas comme il faut, et finalement on s'arrête. À la fin, il manquait cet extra qui fait que tout jeu de sports peut être amusant[2]. » Ryan Mac Donald de GameSpot attribue à la version PlayStation du jeu une note de 4,6 sur 10, décrivant le jeu comme « pas impressionnant » et fustigeant des graphismes « au look poli » et ses contrôles « simples, presque ennuyeux »[3]. Cependant, son collègue Michael E. attribue une bien meilleure note à la version PC (6,9 sur 10)[4].
