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Rhizoctonia

genre de champignons

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Rhizoctonia
Description de cette image, également commentée ci-après
maladie du concombre due à Rhizoctonia solani
Classification
Règne Fungi
Division Basidiomycota
Sous-embr. Agaricomycotina
Classe Agaricomycetes
Ordre Cantharellales
Famille Ceratobasidiaceae

Genre

Rhizoctonia
DC.

Rhizoctonia est un genre de champignons (Fungi) anamorphes de l'ordre des Cantharellales. Ces espèces ne produisent pas de spores, mais sont constituées d'hyphes et de sclérotes et sont l'état asexué des champignons du genre Thanatephorus.
Habituellement saprophytes (décomposeurs), ces organismes s'attaquent parfois à des plantes vivantes affaiblies, dont en situation de grande culture.

Biologie et phytopathologies modifier

Les espèces de Rhizoctonia sont habituellement saprotrophes, c'est-à-dire qu'elles dégradent utilement la matière organique morte (nécromasse en contribuant au Cycle du carbone, mais face à des plantes fragilisées (par exemple par de faibles doses d'un désherbant total tel que le glyphosate, elles peuvent devenir des pathogènes « facultatifs » des plantes. Elles provoquent ainsi sur les cultures des maladies de grande importance économique. Il a été montré dans les années 1990 que la présence ou rémanence de glyphosate dans le sols favorise l'infection de racines de plantes cultivées dans le même sol, et la mort d'une partie des graines qui y seraient plantées trop précocement après le traitement[1] (ceci est également vrai pour une autre espèce de champignon pathogène posant souvent problème en agriculture (Physum sp.).

Rhizoctonia est aussi associées aux orchidées par les mycorhizes.

Taxonomie modifier

Ce genre regroupait précédemment de nombreux champignons superficiellement similaires, mais sans aucune parenté.

Synonyme : Moniliopsis Ruhland.

Histoire modifier

Le nom « Rhizoctonia » fut forgé en 1815 par le mycologue suisse Augustin Pyramus de Candolle pour désigner des champignons pathogènes des plantes qui produisent à la fois des hyphes et des sclérotes. « Rhizoctonia » signifie « tueur de racines ». L'espèce originale de De Candolle, Rhizoctonia crocorum (téléomorphe Helicobasidium purpureum), est l'agent causal du rhizoctone violet de la carotte et d'autres légumes-racines[2].

Par la suite, différents auteurs ont rattaché plus d'une centaine d'espèces à ce genre, la plupart de ces pathogènes de plantes n'ayant cependant qu'une ressemblance superficielle avec l'espèce type[3]. Rhizoctonia est ainsi devenue un genre artificiel comprenant une grande variété d'espèces non apparentées[4].

Recherchant une classification plus naturelle des champignons, R.T. Moore proposa en 1987 de restreindre le genre Rhizoctonia à son espèce-type et aux espèces apparentées, et de déplacer dans d'autres genres les espèces non-apparentées[5]. Cependant cela aurait nécessité que Rhizoctonia solani (téléomorphe Thanatephorus cucumeris), espèce très connue mais non-apparentée, soit renommée en Moniliopsis solani. Pour l'éviter, on a proposé que Rhizoctonia solani devienne l'espèce-type de Rhizoctonia à la place de Rhizoctonia crocorum. Cette proposition fut acceptée et le type de Rhizoctonia est désormais conservé comme Rhizoctonia solani[6]. dans le cadre du Code international de nomenclature botanique[7].

Statut actuel modifier

Le genre, dans son acception actuelle, est en fait restreint à l'espèce-type, Rhizoctonia solani, et à ses synonymes. Le nom du genre est toutefois encore largement utilisé dans son ancienne acception, artificielle. Des recherches moléculaires, basées sur l'analyse cladistique des séquences d'ADN, placent Rhizoctonia dans la famille des Ceratobasidiaceae[8].

Reclassement des anciennes espèces modifier

Une révision complète et un reclassement des noms d'espèces du genre Rhizoctonia fut publiée en 1994 par Andersen et Stalpers[4]. Seuls quelques noms fréquemment utilisés sont listés ci-dessous. Beaucoup de noms anciens ont une application incertaine ou n'ont jamais eu de publication valide, ou les deux[4].

Liste d'espèces modifier

D'après la 10e édition de Dictionary of the Fungi[10] (2007), ce genre est constitué des espèces anamorphes suivantes :

La taxinomie de ses deux taxons reste à résoudre :

  • Rhizoctonia endophytica var. endophytica H.K. Saksena & Vaartaja (1960)
  • Rhizoctonia endophytica var. filicata H.K. Saksena & Vaartaja (1960)

Habitat et distribution modifier

Les espèces sont saprotrophes, vivant dans le sol et produisant des basidiocarpes (fructifications du téléomorphe Thanatephorus) sur les tiges mortes et les détritus végétaux. Ce sont aussi des pathogènes opportunistes des végétaux, avec une gamme d'hôtes pratiquement illimitée, et on les a aussi isolés des mycorhizes d'orchidées. Leur distribution semble être cosmopolite[11].

Importance économique modifier

Rhizoctonia solani provoque un grand nombre de maladies fongiques économiquement significatives. C'est l'un des champignons responsables de la fonte des semis, mais aussi du rhizoctone brun de la pomme de terre[12], du rhizoctone des céréales[13], du pourridié de la betterave à sucre[14], de la pourriture du concombre[15], du flétrissement de la gaine du riz[16], et de nombreuses autres maladies[11].

Notes et références modifier

  1. ↑ Smiley, R.W., Ogg, A.G. Jr., and Cook, R.J. (1992) Influence of glyphosate on Rhizoctonia root rot, growth and yield of barley. Plant Disease 76: 937-942 (Notice/résumé Inist-CNRS).
  2. ↑ (en) [1].
  3. ↑ a b c d e et f (en) [2].
  4. ↑ a b c d e f g h i j k et l (en) Andersen TF, Stalpers JA., « A checklist of Rhizoctonia epithets », Mycotaxon, vol. 51,‎ , p. 437–457
  5. ↑ (en) Moore RT., « The genera of Rhizoctonia-like fungi », Mycotaxon, vol. 29,‎ , p. 91–99
  6. ↑ (en) K. G. Mukerji, C. Manoharachary, Taxonomy and Ecology of Indian Fungi, I. K. International Pvt, , 293 p. (ISBN 978-93-80026-92-3, lire en ligne), p. 24-25.
  7. ↑ (en) « International Code of Botanical Nomenclature, Appendix III, Nomina generica conservanda et rejicienda - B. Fungi », International Association for Plant Taxonomy (IAPT), (consulté le ).
  8. ↑ (en) Moncalvo J-M et al., « The cantharelloid clade: dealing with incongruent gene trees and phylogenetic reconstruction methods », Mycologia, vol. 98, no 6,‎ , p. 937–948 (PMID 17486970, DOI 10.3852/mycologia.98.6.937, lire en ligne [archive du ]).
  9. ↑ (en) Adams GC, Kropp BR., « Athelia arachnoidea, the sexual state of Rhizoctonia carotae, a pathogen of carrot in cold storage », Mycologia, vol. 88, no 3,‎ , p. 459–472 (DOI 10.2307/3760886, lire en ligne)
  10. ↑ P.M. Kirk, P.F. Cannon, D.W. Minter, J.A. Stalpers, Dictionary of the Fungi, 10e édition (2007), Wallingford: CABI. (ISBN 0-85199-826-7).
  11. ↑ a et b (en) Roberts P., Rhizoctonia-forming fungi : a taxonomic guide, Kew, Royal Botanic Gardens, , 239 p. (ISBN 1-900347-69-5), p. 239
  12. ↑ (en) Rhizoctonia, disease of potato.
  13. ↑ (en) Rhizoctonia root rot.
  14. ↑ (en) Rhizoctonia diseases of sugar beet « Copie archivée » (version du sur Internet Archive).
  15. ↑ (en) Rhizoctonia disease of cucumber.
  16. ↑ (en) Rhizoctonia sheath blight.

Liens externes modifier

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