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L'écoatlas se veut une alternative aux atlas classiques en proposant un découpage de la planète basée sur des critères écologiques plutôt que politiques, historiques ou géophysiques. Basé sur la classification adoptée par le Fonds mondial pour la nature (WWF), il présente une image de la nature telle qu'elle s'est développée avant l'intervention souvent néfaste de l'être humain.

Cette classification des écosystèmes prend pour unité de base l'écorégion, c'est-à-dire un territoire plus ou moins étendu qui présente une homogénéité importante au niveau des espèces végétales et animales qui l'habitent. La trame ainsi obtenue couvre l'ensemble de la biosphère et permet une représentation détaillée de la répartition du vivant, en vue de son étude, de sa protection et de sa sauvegarde.

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