Un pharmacophore est constitué par une partie pharmacologiquement active d'une molécule servant de modèle. Les pharmacophores sont donc des ensembles d'atomes actifs utilisés dans la conception de médicaments. Le pharmacophore est une représentation géométrique idéalisée, seule la modélisation en 3D peut permettre une utilisation optimale pour la création de nouveaux médicaments.

Pharmacophore des antihistaminiques.
Pharmacophore de la benzodiazépine .
Autre exemple de pharmacophore.

Un pharmacophore est l'ensemble des groupements fonctionnels disposés selon un arrangement spatial adéquat, assurant la fixation du médicament sur le récepteur et donc capable d'induire la réponse physiologique[1]. Le squelette de la molécule assure le maintien de cet échafaudage et ne joue a priori pas de rôle déterminant dans le déclenchement de la réponse (pour autant qu'il n'empêche pas l'interaction pour raisons d'encombrement stérique). En théorie les médicaments qui provoquent une réponse physiologique donnée sur un récepteur donné devraient posséder le même pharmacophore[2].

Notes et références modifier

  1. Thomas Seidel, Oliver Wieder, Arthur Garon et Thierry Langer, « Applications of the Pharmacophore Concept in Natural Product inspired Drug Design », Molecular Informatics, vol. 39, no 11,‎ , p. 2000059 (ISSN 1868-1743, PMID 32578959, PMCID 7685156, DOI 10.1002/minf.202000059, lire en ligne, consulté le )
  2. (en) Deborah Giordano, Carmen Biancaniello, Maria Antonia Argenio et Angelo Facchiano, « Drug Design by Pharmacophore and Virtual Screening Approach », Pharmaceuticals, vol. 15, no 5,‎ , p. 646 (ISSN 1424-8247, PMID 35631472, PMCID PMC9145410, DOI 10.3390/ph15050646, lire en ligne, consulté le )

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