Le centre a vu le jour en 1974 sous les ordres de Pierre Tournier mais ce n'est que le qu'il est inauguré sous sa configuration actuelle. Il se situe dans la commune de Seloncourt sur les 11 ha du domaine du château de Jean-Pierre Peugeot[1]. Le , Éric Hély devient directeur du centre de formation en remplacement de Jean-Luc Ruty qui occupait le poste depuis 1999.
Les prémices de la formation : l'opération Lionceaux dès 1949modifier
Club pionnier du professionnalisme, le FC Sochaux et son mécène, Peugeot subissent les conséquences financières de la guerre. Ne disposant plus des moyens financiers nécessaires au recrutement de joueurs vedettes, comme ce fut le cas dans les années 1930, le FCSM crée la phalange Lionceaux. Pour la première fois, un club professionnel français détecte de jeunes talents sur l’ensemble du territoire national avant que ceux-ci ne poursuivent leur apprentissage du football dans une structure créée pour l’occasion. Cette stratégie permettra au club de rester au plus haut niveau jusqu'en 1974 et la création du centre de formation.
Les jeunes talents sont repérés dans toutes les régions de France, notamment via le réseau Peugeot. Ils sont ensuite logés ensemble au Cercle Hôtel à Sochaux, là où les ingénieurs célibataires de Peugeot sont également accueillis. Des principes leur sont inculqués tant en matière de football le matin que dans leurs métiers qu'ils pratiquent l’après-midi aux usines Peugeot.
À l'été 1949, ce sont onze joueurs recrutés dans toute la France qui sont placés sous la conduite de deux anciens joueurs, Robert Zurcher et Jean Pessonneaux, et sous le regard de Paul Wartel, l’entraîneur de l’équipe première qui les intègre quatre fois par semaine. Plus tard, lors de la saison 1952/1953, la quasi-totalité de ses éléments ont signé leur premier contrat professionnel en faveur du FCSM et l’équipe termine vice-championne de France et remporte la Coupe Drago. À l’occasion d’un match contre Lens, Gaby Dormois n’aligne même que des joueurs passés par l’école sochalienne.
Le centre de formation recrute uniquement sur avis de ses recruteurs. Ainsi, le club dispose de 9 recruteurs sur l’hexagone qui ne s’occupent que des jeunes de 12-13 ans jusqu’à 18-19 ans. Ensuite, c'est Bernard Maraval, le coordinateur du recrutement des jeunes sous la tutelle de Jean-Luc Ruty qui compile ces informations et les oriente selon les besoins du club. Le club organise également des stages d’observation.
Joueurs ayant signé leurs premiers contrats professionnels au centre de formationmodifier
Jean Calvé 
Mevlüt Erding 
Badara Sène 
Hakim El Bounadi 
Rafael Dias 
Sanjin Prcić 
Hillel Konaté 
