Alveolata

Balantidium coli

Classification WoRMS
Règne	Chromista
Sous-règne	Harosa

Infra-règne

Alveolata
Cavalier-Smith, 1991

Embranchements de rang inférieur

Position phylogénétique

Eukaryota
- Unikonta
  - Amoebozoa
  - Opisthokonta
    - Holomycota
      - Nucleariida
      - Fungi
    - Holozoa
      - Mesomycetozoa
      - Filozoa
        Filasterea
        
        Choanobionta
        Choanomonada
        
        Metazoa
- Bikonta
  - Apusozoa
  - Excavata
  - Plantae
  - Chromalveolata s.l.
    - Hacrobia
      - Cryptophyta
      - Haptophyta
    - Harosa

Le groupe des Alvéolés (Alveolata), ou alvéolobiontes, est constitué d'organismes vivants unicellulaires de formes assez diverses. La monophylie du groupe est basée essentiellement sur l'étude des ARNr 18S. Il existe cependant un caractère qui leur est propre : la présence de vésicules sous-membranaires, les alvéoles (d'où ce taxon tire son nom), largement distribuées et pouvant servir de réservoir calcique, ou contenir un matériel dense comme les plaques thécales des dinophytes.

Les plus anciens fossiles d'alvéolobiontes connus sont des dinophytes du Silurien (-420 Ma).

Caractéristiques modifier

La caractéristique commune la plus notable est la présence d'alvéoles (sacs) corticales (près de la surface). Ce sont des vésicules (sacs) aplaties disposées en une couche juste sous la membrane et la soutenant, contribuant généralement à une pellicule flexible (peau fine). Dans les dinoflagellés blindés, ils peuvent contenir des plaques rigides. Les alvéolés ont des mitochondries avec des crêtes tubulaires (invaginations) et les cellules ont souvent des intrusions semblables à des pores à travers la surface cellulaire. Le groupe contient des organismes libres et parasites, des flagellés prédateurs et des organismes photosynthétiques.

Micrographie électronique à transmission d'une section mince de la surface du cilié Paramecium putrinum, montrant les alvéoles (flèches rouges) sous la surface cellulaire

Classification modifier

Le groupe des alvéolobiontes rassemble :

Les ciliés, avec plus de 7000 espèces, comme la paramécie ou le stentor.
Les dinophytes, organismes unicellulaires autotrophes par endosymbiose d'une algue verte.
Les apicomplexes, des protistes parasites responsables de maladies comme le paludisme chez les animaux plus complexes. Ils sont dépourvus d'appareil locomoteur.

N.B. Les foraminifères qui y avaient été incorporées par certains auteurs sont maintenant rattachées aux Rhizaria.

Article détaillé : Chromalveolata (classification phylogénétique).

Selon BioLib (12 septembre 2020)^[1] :

embranchement des Apicomplexa Levine, 1970
embranchement des Ciliophora Doflein, 1901
embranchement des Dinozoa

Selon World Register of Marine Species (12 septembre 2020)^[2] :

embranchement des Ciliophora Doflein, 1901
- sous-embranchement des Intramacronucleata
- sous-embranchement des Postciliodesmatophora
embranchement des Myzozoa Cavalier-Smith & Chao
- sous-embranchement des Apicomplexa

Phylogénie modifier

Basé sur une compilation des œuvres suivantes^[3]^,^[4]^,^[5]^,^[6].

Alveolata

Ciliophora

Postciliodesmatophora

	Heterotrichea

	Karyorelictea

Lamellicorticata

	Cariacotrichea

	Spirotrichea

Ventrata

Protocruziea

?Discotrichida

Colpodea

	Nassophorea

	Phyllopharyngea

Prostomatea

	Plagiopylea

	Oligohymenophorea

Colponemidia

Acavomonadia

Apicomplexa s.l.

	Coccidiomorphea (Coccidia et Hematozoa)

	Marosporida

Dinoflagellata s.s.

	Noctiluciphyceae

	Dinophyceae

Des recherches récentes indiquent que les Dinoflagelllata ont en fait émergé des Perkinsea. De plus, les Perkinsea ont émergé des Apicomplexa^[7].

Notes et références modifier

↑ BioLib, consulté le 12 septembre 2020
↑ World Register of Marine Species, consulté le 12 septembre 2020
↑ Ruggiero MA, Gordon DP, Orrell TM, Bailly N, Bourgoin T, Brusca RC, Cavalier-Smith T, Guiry MD, Kirk PM, « A higher level classification of all living organisms », PLOS ONE, vol. 10, n^o 4,‎ 2015, e0119248 (PMID 25923521, PMCID 4418965, DOI 10.1371/journal.pone.0119248 , Bibcode 2015PLoSO..1019248R)
↑ Silar, Philippe, « Protistes Eucaryotes: Origine, Evolution et Biologie des Microbes Eucaryotes », HAL Archives-ouvertes,‎ 2016, p. 1–462 (lire en ligne)
↑ Thomas Cavalier-Smith, « Kingdom Chromista and its eight phyla: a new synthesis emphasising periplastid protein targeting, cytoskeletal and periplastid evolution, and ancient divergences », Protoplasma, vol. 255, n^o 1,‎ 5 septembre 2017, p. 297–357 (PMID 28875267, PMCID 5756292, DOI 10.1007/s00709-017-1147-3)
↑ Varsha Mathur, Waldan K. Kwong, Filip Husnik, Nicholas A. T. Irwin, Árni Kristmundsson, Camino Gestal, Mark Freeman et Patrick J Keeling, « Phylogenomics Identifies a New Major Subgroup of Apicomplexans, Marosporida class nov., with Extreme Apicoplast Genome Reduction », Oxford University Press, vol. 13, n^o 2: evaa244,‎ 18 novembre 2020 (ISSN 1759-6653, PMID 33566096, PMCID 7875001, DOI 10.1093/gbe/evaa244)
↑ (en) Jürgen F H Strassert, Anna Karnkowska, Elisabeth Hehenberger, Javier del Campo, Martin Kolisko, Noriko Okamoto, Fabien Burki, Jan Janouškovec et Camille Poirier, « Single cell genomics of uncultured marine alveolates shows paraphyly of basal dinoflagellates », The ISME Journal, vol. 12, n^o 1,‎ 2018, p. 304–308 (ISSN 1751-7370, PMID 28994824, PMCID 5739020, DOI 10.1038/ismej.2017.167)

Voir aussi modifier

Articles connexes modifier

Classification phylogénétique du vivant par Guillaume Lecointre et Hervé Le Guyader aux éditions Belin

Liens externes modifier

Sur les autres projets Wikimedia :

Alveolata, sur Wikimedia Commons
Alveolata, sur Wikispecies

(en) Référence BioLib : Alveolata Cavalier-Smith, 1991 (consulté le 21 juillet 2017)
(fr + en) Référence ITIS : Alveolata (consulté le 21 juillet 2017)
(en) Référence NCBI : Alveolata (taxons inclus) (consulté le 21 juillet 2017)
(en) Référence Tree of Life Web Project : Alveolata (consulté le 21 juillet 2017)
(en) Référence Paleobiology Database : Alveolata (consulté le 21 juillet 2017)
(en) Référence WoRMS : Alveolata Cavalier-Smith (+ liste embranchements + liste classes) (consulté le 21 juillet 2017)
Les Alveolata, projet Tree of Life (en)

[BioLib12_septembre_2020-1] BioLib, consulté le 12 septembre 2020

[WRMS12_septembre_2020-2] World Register of Marine Species, consulté le 12 septembre 2020

[Ruggiero15-3] Ruggiero MA, Gordon DP, Orrell TM, Bailly N, Bourgoin T, Brusca RC, Cavalier-Smith T, Guiry MD, Kirk PM, « A higher level classification of all living organisms », PLOS ONE, vol. 10, n^o 4,‎ 2015, e0119248 (PMID 25923521, PMCID 4418965, DOI 10.1371/journal.pone.0119248 , Bibcode 2015PLoSO..1019248R)

[4] Silar, Philippe, « Protistes Eucaryotes: Origine, Evolution et Biologie des Microbes Eucaryotes », HAL Archives-ouvertes,‎ 2016, p. 1–462 (lire en ligne)

[Cavalier-Smith_2017-5] Thomas Cavalier-Smith, « Kingdom Chromista and its eight phyla: a new synthesis emphasising periplastid protein targeting, cytoskeletal and periplastid evolution, and ancient divergences », Protoplasma, vol. 255, n^o 1,‎ 5 septembre 2017, p. 297–357 (PMID 28875267, PMCID 5756292, DOI 10.1007/s00709-017-1147-3)

[Mathur_2021-6] Varsha Mathur, Waldan K. Kwong, Filip Husnik, Nicholas A. T. Irwin, Árni Kristmundsson, Camino Gestal, Mark Freeman et Patrick J Keeling, « Phylogenomics Identifies a New Major Subgroup of Apicomplexans, Marosporida class nov., with Extreme Apicoplast Genome Reduction », Oxford University Press, vol. 13, n^o 2: evaa244,‎ 18 novembre 2020 (ISSN 1759-6653, PMID 33566096, PMCID 7875001, DOI 10.1093/gbe/evaa244)

[7] (en) Jürgen F H Strassert, Anna Karnkowska, Elisabeth Hehenberger, Javier del Campo, Martin Kolisko, Noriko Okamoto, Fabien Burki, Jan Janouškovec et Camille Poirier, « Single cell genomics of uncultured marine alveolates shows paraphyly of basal dinoflagellates », The ISME Journal, vol. 12, n^o 1,‎ 2018, p. 304–308 (ISSN 1751-7370, PMID 28994824, PMCID 5739020, DOI 10.1038/ismej.2017.167)

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