Microbiomasse
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La microbiomasse (appelée aussi micro-biomasse ou micromasse) désigne la masse totale de l'ensemble des micro-organismes vivant dans un milieu, qu'il soit naturel ou artificiel, à un moment donné. Cette masse est quantitativement déterminée par la somme de celle de l'ensemble des bactéries, champignons, levures, algues unicellulaires et protozoaires vivant dans le milieu considéré.
Par extension, on définit la microbiomasse d'un organisme comme étant la masse totale de l'ensemble des micro-organismes vivant du microbiote de cet organisme à un moment donné. Ainsi la microbiomasse chez l'être humain est la masse totale du microbiote de l'organisme humain tout comme la microbiomasse d'une personne désigne la masse totale de son microbiote.
De même, par extension, il est possible de parler de la microbiomasse d'un microbiote particulier d'un organisme de sorte que la microbiomasse intestinale chez l'être humain correspond à la masse totale de son microbiote intestinal.
D'une façon plus extensive, il est possible de parler de la microbiomasse intestinale chez l'espèce humaine (masse totale du microbiote intestinal en prenant en compte l'ensemble de tous les individus de l'espèce humaine) ou encore de la microbiomasse chez l'espèce humaine (masse totale du microbiote en prenant en compte l'ensemble de tous les individus de l'espèce humaine).
Par ailleurs, la micro-biomasse n'est que l'une des composantes de la biomasse. Outre la phytomasse (biomasse liée au règne végétal), et la zoomasse (biomasse liée au règne animal), on trouve la lithomasse (biomasse liée au milieu rocheux), l'hydromasse (biomasse liée au milieu aquatique) et l'aéromasse (biomasse liée au milieu aérien)[1],[2].
Évaluation modifier
Du point de vue quantitatif, la micro-biomasse peut être approchée par le comptage de cellules, par la mesure de la chlorophylle (pour le phytoplancton), par la mesure de la respiration des organismes (du sol par exemple) ou par la quantification de l'ATP présent (dans un sédiment par exemple[3]. Ces méthodes ne repèrent toutefois pas les organismes vivants mais « en sommeil » au moment de l'analyse.
Pour avoir des précisions sur le type d'organismes présent, il faut faire appel au microscope et/ou à des techniques émergentes telles que le métabarcoding.
À l'échelle de la planète, la biomasse des micro-organismes constituerait au moins 20 % de la biomasse totale[4]. Pour Nicolas Beroutchachvili et Jean-Louis Mathieu (1977) c'est l'une des composantes importantes de l'éthologie des géosystèmes[1]
Exemples modifier
Les biofilms et le bactérioplancton sont deux exemples de communautés de micro-organismes pouvant constituer une fraction de la micro-biomasse d'un milieu donné. La microbiomasse de plancton peut être un indicateur d'eutrophisation, de dystrophisation ou renseigner un ostréiculteur sur le potentiel nourricier de l'eau pour les huîtres[5],[6].
Références modifier
- « L'éthologie des géosystèmes », Beroutchachvili, N., Mathieu, J. L., L'Espace géographique, (1977), 6(2), 73-84,
- « Les structures verticales des géosystèmes », Nicolas Beroutchachvili, Jean Radvanyi, Revue géographique des Pyrénées et du Sud-Ouest, 1978, Vol. 49 no 2 pp. 181-198
- Delmas, D. (1983). Les glucides et l'évolution de la matière organique dans les sédiments marins. Oceanologica Acta, 6(2), 157-165.
- « La biomasse des micro-organismes »
- Frikha, M. G., Linley, E. A. S., & Delmas, D. (1987). Évolution annuelle et saisonnière de la microbiomasse d'une claire à huîtres: importance des populations bactérioplanctoniques. Oceanis, 13(4-5), 433-447.
- Le Gall S, Bel Hassen M & Le Gall P (1997) Ingestion of a bacterivorous ciliate by the oyster Crassostrea gigas: protozoa as a trophic link between picoplankton and benthic suspension-feeders. Marine Ecology Progress Series, 152(1-3), 301-306.
Voir aussi modifier
Bibliographie modifier
- Aleya L (1989) Couplage saisonnier entre nucléotides adényliques et activité photosynthétique de diverses fractions de taille phytoplanctoniques en milieu lacustre eutrophe. European journal of protistology, 24(4), 381-391.
- Aleya L, Devaux J, El Magouri H, Marvalin O & Amblard C (1988) Usefulness of simultaneous use of several methods for the estimation of phytoplanktonic biomass. European journal of protistology, 23(4), 334-342.
- Delmas D & Romano J.C (1980) Évaluation indirecte de la biomasse et de l'activité des microorganismes dans les sédiments de l'étang de Berre. Relations avec les teneurs et la diagenèse de la matière organique. Tethys, 9, 285-297.
- Moal, J., Le Coz, J. R., Samain, J. F., & Daniel, J. Y. (1989). Nucleotides in bivalves: extraction and analysis by high-performance liquid chromatography (HPLC). Comparative Biochemistry and Physiology Part B: Comparative Biochemistry, 93(2), 307-316.
- Romano J.C (1982) Les nucléotides adenyliques (ATP, ADP, AMP) dans le milieur marin (matière organique particulière des eaux et sédiments superficiels): application à l'étude de la microbiomasse (Doctoral dissertation).
