SNAI1

SNAI1
Structures disponibles
PDB	Recherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB
	2Y48, 3W5K, 4QLI
Identifiants
Aliases	SNAI1
IDs externes	OMIM: 604238 MGI: 98330 HomoloGene: 4363 GeneCards: SNAI1
Position du gène (Homme)
Chr.	Chromosome 20 humain
Fin	49,988,886 bp
Position du gène (Souris)
Chr.	Chromosome 2 (souris)
Fin	167,384,734 bp
Expression génétique
	Fortement exprimé dans
	vésicule biliaire; ; left uterine tube; ; gonade; ; right lobe of thyroid gland; ; left lobe of thyroid gland; ; aorte ascendante; ; upper lobe of left lung; ; poumon droit; ; artère coronaire gauche; ; auricule droit;
	Fortement exprimé dans
	lamina propria of urethra; ; Crête neurale; ; tail of embryo; ; lamina propria of vagina; ; desmocrâne; ; mésoderme; ; embryon; ; Primary palate; ; granulocyte; ; calvaria;
	Plus de données d'expression de référence
	Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire	sequence-specific DNA binding; liaison ADN; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; liaison ion métal; liaison de kinase; liaison protéique; DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; Fixation d'acide nucléique; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; E-box binding;
Composant cellulaire	noyau; cytoplasme; nucléoplasme; pericentric heterochromatin; cytosol;
Processus biologique	trophoblast giant cell differentiation; roof of mouth development; regulation of bicellular tight junction assembly; positive regulation of cell migration; regulation of transcription by RNA polymerase II; epithelial to mesenchymal transition involved in endocardial cushion formation; negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; développent d'un organisme multicellulaire; negative regulation of vitamin D biosynthetic process; régulation positive de la transcription dépendante de l'ADN; negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator; osteoblast differentiation; negative regulation of cell differentiation involved in embryonic placenta development; cartilage morphogenesis; hair follicle morphogenesis; left/right pattern formation; mesoderm development; negative regulation of transcription, DNA-templated; migration cellulaire; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; Notch signaling involved in heart development; mesoderm formation; Transition épithélio-mésenchymateuse; positive regulation of epithelial to mesenchymal transition; heterochromatin organization; aortic valve morphogenesis;
	Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
	6615
	20613
	ENSG00000124216
	ENSMUSG00000042821
	O95863
	Q02085
	NM_005985
	NM_011427
	NP_005976
	NP_035557
	Wikidata
Voir/Editer Humain	Voir/Editer Souris

Le SNAI1 (appelé aussi snail ou snail1) est un facteur de transcription à doigt de zinc. Son gène est le SNAI1 situé sur le chromosome 20 humain.

Rôles

Il réprime l'expression des claudines et des occludines intervenant dans les jonctions serrées au niveau de la transition épithélium-mésenchyme^[5], ce qui constitue une autre voie d'action que celle de la cadhérine E ^[6].

En médecine

Plusieurs germes permettent l'activation de cette protéine entraînant une perméabilité de la barrière hémato-encéphalique^[7].

Notes et références

↑ ^{a b et c} GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000124216 - Ensembl, May 2017
↑ ^{a b et c} GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000042821 - Ensembl, May 2017
↑ « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
↑ « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
↑ Ikenouchi J, Matsuda M, Furuse M, Tsukita S, Regulation of tight junctions during the epithelium-mesenchyme transition: direct repression of the gene expression of claudins/occludin by Snail, J Cell Sci, 2003;116:1959–1967
↑ Ohkubo T, Ozawa M, The transcription factor Snail downregulates the tight junction components independently of E-cadherin downregulation, J Cell Sci, 2004;117:1675–1685
↑ Kim BJ, Hancock BM, Bermudez A et al. Bacterial induction of Snail1 contributes to blood-brain barrier disruption, J Clin Invest, 2015;125:2473-2483

[refGRCh38Ensembl-1] {a b et c} GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000124216 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] {a b et c} GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000042821 - Ensembl, May 2017

[3] « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine

[4] « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine

[Ikenouchi_2003-5] Ikenouchi J, Matsuda M, Furuse M, Tsukita S, Regulation of tight junctions during the epithelium-mesenchyme transition: direct repression of the gene expression of claudins/occludin by Snail, J Cell Sci, 2003;116:1959–1967

[Ohkubo_2004-6] Ohkubo T, Ozawa M, The transcription factor Snail downregulates the tight junction components independently of E-cadherin downregulation, J Cell Sci, 2004;117:1675–1685

[Kim_2015-7] Kim BJ, Hancock BM, Bermudez A et al. Bacterial induction of Snail1 contributes to blood-brain barrier disruption, J Clin Invest, 2015;125:2473-2483

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]