Liste d'espèces d'algues dont le génome est séquencé
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La liste des génomes d’algues séquencés présentée ci-après répertorie toutes les espèces d’algues dont le séquençage du génome complet est disponible publiquement. Les ébauches de génomes ne sont pas inclus dans la liste, ni le séquençage d'organites exclusivement.
Glaucophytes modifier
- Cyanophora paradoxa (2012[1])
Algues vertes modifier
- Bathycoccus prasinos BBAN7, Joint Genome Institute
- Chlamydomonas reinhardtii CC-503 cw92 mt+, organisme modèle, (2007[2])
- Chlorella variabilis NC64A, algue verte (2010[3])
- Coccomyxa subellipsoidea sp. C-169, possible source de biocarburant (2007[4])
- Dunaliella salina CCAP19/18, Joint Genome Institute
- Micromonas pusilla CCMP1545, phytoplancton marin (2007[5],[6])
- Micromonas pusilla RCC299/NOUM17, phytoplancton marin (2007[7],[6])
- Ostreococcus lucimarinus CCE9901, eucaryote simple, petit génome (2007[8])
- Ostreococcus tauri OTH95, eucaryote simple, petit génome (2006[9])
- Ostreococcus sp. RCC809, Joint Genome Institute
- Volvox carteri, algue multicellulaire, organisme modèle (2010[10])
Algues rouges modifier
- Chondrus crispus Genoscope
- Cyanidioschyzon merolae Strain:10D, eucaryote simple (2004[11])
- Galdieria sulphuraria [12]
- Pyropia yezoensis, Bangiophyceae[13]
Algues brunes (Phaeophyceae) modifier
- Ectocarpus siliculosus, parent éloigné des plantes (2010[15])
Heterokontophyta modifier
- Aureococcus anophagefferens CCMP1984 (Pelagophyceae)
- Chroomonas mesostigmatica CCMP1168 (Cryptophyta)
- Cryptomonas paramecium (Cryptophyta)
- Emiliania huxleyi CCMP1516 (Prymnesiophyceae)
- Emiliania huxleyi RCC1217 (Prymnesiophyceae)
- Fragilariopsis cylindrus (Bacillariophyta)
- Guillardia theta (nucléomorphe seulement) (Cryptophyceae)
- Hemiselmis andersenii CCMP7644 (Cryptophyceae)
- Nannochloropis gaditana CCMP526 (Eustigmatophyceae)
- Phaeodactylum tricornutum CCAP1055/1 (Bacillariophyta)
- Pseudo-nitzschia multiseries (Bacillariophyta)
- Thalassiosira pseudonana CCMP 1335 (Bacillariophyta)
Chlorarachniophytes modifier
Articles connexes modifier
- Liste des génomes d'animaux séquencés
- Liste d'espèces archéennes dont le génome est séquencé
- Liste d'espèces protéobacteriennes dont le génome est séquencé
- Liste d'espèces eubactériennes dont le génome est séquencé
- Liste des génomes de champignons séquencés
- Liste d'espèces de plantes dont le génome est séquencé
- Liste des génomes d'eucaryotes séquencés
- Liste des génomes de protistes séquencés
- Liste des plastomes séquencés
Notes et références modifier
- Cet article est partiellement ou en totalité issu de l'article intitulé « Liste d'espèces de plantes dont le génome est séquencé » (voir la liste des auteurs).
- Price DC, Chan CX, Yoon HS, et al., « Cyanophora paradoxa genome elucidates origin of photosynthesis in algae and plants », Science, vol. 335, no 6070, , p. 843-847 (PMID 22344442, DOI 10.1126/science.1213561)
- Merchant et al., SE Prochnik, O Vallon, EH Harris, SJ Karpowicz, GB Witman, A Terry, A Salamov et LK Fritz-Laylin, « The Chlamydomonas Genome Reveals the Evolution of Key Animal and Plant Functions », Science, vol. 318, no 5848, , p. 245–250 (PMID 17932292, PMCID 2875087, DOI 10.1126/science.1143609, Bibcode 2007Sci...318..245M)
- Blanc G, Duncan G, Agarkova I, et al., « The Chlorella variabilis NC64A genome reveals adaptation to photosymbiosis, coevolution with viruses, and cryptic sex », Plant Cell, vol. 22, no 9, , p. 2943–2955 (PMID 20852019, PMCID 2965543, DOI 10.1105/tpc.110.076406)
- Coccomyxa JGI entry
- Micromonas p.C3 JGI entry
- Worden AZ, Lee JH, Mock T, et al., « Green evolution and dynamic adaptations revealed by genomes of the marine picoeukaryotes Micromonas », Science, vol. 324, no 5924, , p. 268–272 (PMID 19359590, DOI 10.1126/science.1167222, Bibcode 2009Sci...324..268W)
- Micromonas p.N3 JGI entry
- B Palenik, J Grimwood, A Aerts, P Rouzé, A Salamov, N Putnam, C Dupont, R Jorgensen et E Derelle, « The tiny eukaryote Ostreococcus provides genomic insights into the paradox of plankton speciation », Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 104, no 18, , p. 7705–10 (PMID 17460045, PMCID 1863510, DOI 10.1073/pnas.0611046104, Bibcode 2007PNAS..104.7705P)
- Derelle E, Ferraz C, Rombauts S, et al., « Genome analysis of the smallest free-living eukaryote Ostreococcus tauri unveils many unique features », PNAS, vol. 103, no 31, , p. 11647–52 (PMID 16868079, PMCID 1544224, DOI 10.1073/pnas.0604795103, Bibcode 2006PNAS..10311647D)
- Prochnik SE, Umen J, Nedelcu AM, et al., Umen, Nedelcu, Hallmann, Miller, Nishii, Ferris, Kuo et Mitros, « Genomic analysis of organismal complexity in the multicellular green alga Volvox carteri », Science, vol. 329, no 5988, , p. 223–226 (DOI 10.1126/science.1188800, Bibcode 2010Sci...329..223P)
- Matsuzaki M, Misumi O, Shin-I T, et al., « Genome sequence of the ultrasmall unicellular red alga Cyanidioschyzon merolae 10D », Nature, vol. 428, no 6983, , p. 653–7 (PMID 15071595, DOI 10.1038/nature02398, Bibcode 2004Natur.428..653M)
- « Galdieria genome »(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?)
- Nakamura et al. (March 11, 2013) The First Symbiont-Free Genome Sequence of Marine Red Alga, Susabi-nori (Pyropia yezoensis). PLoS ONE 8(3): e57122. DOI:10.1371/journal.pone.0057122.
- Bhattacharya et al. (June 17, 2013) Genome of the red alga Porphyridium purpureum. Nature communications 4:1941. DOI:10.1038/ncomms2931.
- Cock JM, Sterck L, Rouzé P, et al., Sterck, Rouzé, Scornet, Allen, Amoutzias, Anthouard, Artiguenave et Aury, « The Ectocarpus genome and the independent evolution of multicellularity in brown algae », Nature, vol. 465, no 7298, , p. 617–621 (PMID 20520714, DOI 10.1038/nature09016, Bibcode 2010Natur.465..617C)
