Excavata
| Règne | Protozoa |
|---|---|
| Sous-règne | Eozoa |
Embranchements de rang inférieur
Les Excavata (Excavés, ce qui signifie creusés) ou Excavobionta sont un infra-règne d'eucaryotes unicellulaires hétérotrophes et généralement flagellés. Le type ancestral se caractérise par la présence d'une zone creusée, le cytostome, permettant l'ingestion de fines particules alimentaires. De nombreux excavates sont anaérobies ou microaérophile et contiennent des organites particuliers et spécialisés : les mitosomes et les hydrogénosomes, ex. : Diplomonade
De nombreux Excavobiontes sont des parasites de l'homme ou d'autres animaux. ex. : Trypanosomes, Giardia
Certains possèdent des plastes (endosymbionte secondaire) et sont photosynthétiques : Euglénoides
Les excavés étaient inclus autrefois dans le règne aujourd'hui obsolète des Protista[1].
Ils sont classifiés selon leurs structures flagellaires[2] et ils sont considérés comme la lignèe la plus basale des flagellés[3].
Les excavés du sous-règne des Discoba (Jakobea, Tsukubea, Euglenozoa et Percolozoa) semblent être des eucaryotes de type basal, tandis que les Neolouka (genre Malawimonas) et les Metamonada semblent maintenant être des clades frères des Podiata.
Les Discoba pourraient être hautement paraphylétiques[4].
Les Euglenobionta et les Metamonada forment deux groupes monophylétiques.
Classification modifier
En 2003 Alastair Simpson écrivait « Pour l'instant, il n'existe pas de système de taxonomie phylogénétique de haut niveau pour décrire les relations fortement étayées entre les « excavata »[2] ». La classification ci-dessous, étant sujette à modification, n'est dont donnée qu'à titre indicatif :
- Sous-règne 1
- Embranchement des Neolouka
- Classe des Malawimonadidea (genre Malawimonas)
- Embranchement des Metamonada
- Super-classe des Anaeromonada (en) ou Preaxostyla (en)
- Super-classe des Trichozoa (en)
- Classe des Fornicata (en)
- Classe des Parabasalia
- Classe des Malawimonas
- Classe des Preaxostyla (en)
- Classe des Jakobida
- Classe des Heterolobosea
- Embranchement des Neolouka
- Sous-règne des Discoba
- Super-embranchement des Discicristata
- Embranchement des Euglenozoa ou Euglenobionta
- Embranchement des Percolozoa
Notes et références modifier
Références modifier
- (en) T Cavalier-Smith, « The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa. », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 52, no 2, , p. 297–354 (PMID 11931142, DOI 10.1099/00207713-52-2-297, lire en ligne)
- (en) AG Simpson, « Cytoskeletal organization, phylogenetic affinities and systematics in the contentious taxon Excavata (Eukaryota) », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 53, no Pt 6, , p. 1759–1777 (PMID 14657103, DOI 10.1099/ijs.0.02578-0)
- (en) Scott C Dawson et Alexander R Paredez, « Alternative cytoskeletal landscapes: cytoskeletal novelty and evolution in basal excavate protists », Current Opinion in Cell Biology, vol. 25, no 1, , p. 134–141 (PMID 23312067, PMCID 4927265, DOI 10.1016/j.ceb.2012.11.005)
- (en) Thomas Cavalier-Smith, Ema E. Chao et Rhodri Lewis, « 187-gene phylogeny of protozoan phylum Amoebozoa reveals a new class (Cutosea) of deep-branching, ultrastructurally unique, enveloped marine Lobosa and clarifies amoeba evolution », Molecular Phylogenetics and Evolution, vol. 99, , p. 275–296 (PMID 27001604, DOI 10.1016/j.ympev.2016.03.023, lire en ligne)
Liens externes modifier
- (en) Référence Paleobiology Database : Excavata (consulté le )
- (en) Référence WoRMS : Excavata Cavalier-Smith (+ liste embranchements + liste classes) (consulté le )
- Tree of Life: Eukaryotes
- Vladimir Hampl et al., 2009, Phylogenomic analyses support the monophyly of Excavata and resolve relationships among eukaryotic “supergroups”
