Abi prism collection
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Abi prism collection est le logiciel chargé de faire la collecte des données brutes d'électrophorèse sur le séquenceur de gène Abi prism 310.
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Le logiciel permet :
- de faire son plan de plaque : noms des échantillons et position sur la plaque
- de lancer l'électrophorèse
Le logiciel effectue le pilotage de l'instrument afin de collecter les données brutes. La séquence des opérations est :
- fermeture du canal du gel bloc du côté de la cuve de tampon,
- coulage d'un nouveau polymère dans le capillaire entre chaque échantillon en agissant sur le piston relié à la seringue de polymère au niveau du gel block. Le vieux polymère est jeté dans le tube poubelle en position trois,
- réouverture du canal du gel block,
- positionnement dans le tube de la plaque correspondant à l'échantillon suivant,
- électro-injection dans le tube,
- rinçage de l'électrode et du capillaire,
- lancement de l'électrophorèse,
- collecte des données d'électrophorèse au bout d'un temps préprogrammé,
- arrêt de la collecte au bout d'un autre temps préprogrammé (30 minutes généralement en gene scan ou 3 heures en séquence)
- appel du programme d'analyse des données (gene-scan analysis ou sequencing analysis)
- passage à l'échantillon suivant : le cycle recommence
