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Épidémie de gastro-entérite et de syndrome hémolytique et urémique de 2011 en Europe

Épidémie infectieuse d'origine alimentaire
Épidémie de gastro-entérite et de syndrome hémolytique et urémique de 2011 en Europe
Répartition géographique des cas.
Maladie
Agent infectieux
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Date d'arrivée
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Morts
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L'épidémie de gastro-entérite et de syndrome hémolytique et urémique de 2011 en Europe (erronément appelée « crise du concombre » à cause du soupçon porté au départ sur des lots de concombres en provenance du sud de l'Espagne[1]), est une épidémie due à la bactérie Escherichia coli O104:H4 du type Escherichia coli entérohémorragique (ECEH) ayant commencé en Allemagne à la mi-mai 2011[2]. Causée par des graines germées issues de l'agriculture biologique[3], elle a fait 53[4] morts et c'est l'épidémie la plus importante de ce type qui soit connue. Elle a entraîné une crise alimentaire et économique dans la filière agricole espagnole[5],[6], puis dans tous les pays européens, d'autant qu'un embargo de la Russie sur tous les légumes en provenance de l'Union européenne est venu s'ajouter à la méfiance des consommateurs[7],[8].

Épidémiologie modifier

L'épidémie s'est propagée dans d'autres pays européens, tels que la Suède, le Danemark, le Royaume-Uni, la France, l'Autriche et les Pays-Bas[source insuffisante].

En France, la précédente épidémie de ce type s'était produite en 2005[9]. Selon un spécialiste de l'institut Pasteur : « C'est la plus grosse épidémie de syndrome hémolytique et urémique (SHU) qu'il y ait jamais eu dans le monde. Tous types confondus d'ECEH[10]. »

Recherche de l'origine de la bactérie modifier

Fausse piste des concombres modifier

 
Le concombre, un temps suspecté et objet de méfiance de la part des consommateurs pendant toute la crise
 
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Dès le début de la crise, les concombres espagnols ont été publiquement accusés d'être à l'origine de la contamination avant d'être disculpés début .

Graines germées modifier

 
Graines germées

Le , les études en Allemagne s'orientent vers la piste des graines germées de haricots mungo (improprement appelés germes de soja), ajoutées à certaines salades composées[11]. Le ministre de la santé allemand, Daniel Bahr, bien que prudent, dit avoir des « indices clairs qu'une entreprise d'Uelzen, dans le nord du pays, est apparemment une source d'infection[12] » mais les premiers tests se révèlent négatifs et le doute sur l'origine de cette crise se réinstalle pendant plusieurs jours[13]. Le , le tabloïd allemand Bild rapporte que la bactérie tueuse a été retrouvée sur les restes d'un concombre se trouvant dans la poubelle d'une famille malade vivant à Magdebourg[14] provoquant à nouveau une crainte autour de ce légume. Finalement, le , le directeur de l'Institut fédéral de veille sanitaire (RHKI) en Allemagne, Reinhard Burger, confirme officiellement que les graines germées sont bien la cause de cette épidémie[15]. La conclusion n'est pas présentée comme irréfutable, mais plutôt comme le produit d'une « chaîne d'indices tellement importante » et d'une absence « d'autre piste sérieuse ». Le , les autorités allemandes déclarent que la ferme Gärtnerhof à Bienenbüttel est à l'origine de la contamination[16].

La souche bactérienne responsable de la maladie a été identifiée comme étant Escherichia coli O104:H4, une souche rare[17] rendue pathogène par la production de Shiga-toxines dont la toxine Stx2[18]. Un cas avait précédemment été documenté en 2005, en Corée[19]. La recherche du « réservoir naturel » (tube digestif d'un animal à sang chaud) est toujours en cours, car cette souche n'a été retrouvée chez aucune espèce animale[20].

Une incertitude s'est exprimée sur l'existence d'un traitement efficace à proposer aux malades[21]. Le , une étude du professeur Bill Keevil de l'Université de Southampton révèle que ces bactéries meurent au contact du cuivre[22].

Le , la souche est retrouvée dans un ruisseau près de Francfort et à proximité d'une station d'épuration[23].

Courant , quelques personnes ayant consommé des graines germées venant de Grande-Bretagne sont contaminées en Gironde près de Bordeaux, les analyses montrent un lien génétique entre les souches allemande et bordelaise[24] alors que cette souche est très rare[25].

La production de graines germées pour consommation humaine, nécessitant un haut degré d'humidité et une température soutenue, est connue depuis longtemps pour être propice au développement de bactéries[26] et est donc soumise à une réglementation très stricte : pas de contact avec des animaux, ni fumier, ni « engrais naturels », inspection pour déceler la présence éventuelle de micro-organismes pathogènes etc. La présence de cette souche bactérienne dans la production de cette ferme n'a donc pas encore été expliquée[27]. Certains commerçants de produits biologiques, en particulier ceux qui produisent principalement des "germes de soja", s'inquiètent des retombées de cette crise sur leurs ventes[28].

Cette ferme, qui a arrêté sa production le [29], aurait respecté les consignes de sécurité selon les autorités allemandes qui n'ont pas formé de plainte[30].

La source de l'infection a été tracée à l'importation de graines contaminées depuis l'Égypte[31].

Conséquences sanitaires modifier

 
Schistocytes chez une personne atteinte de syndrome hémolytique et urémique.

L'épidémie a fait 47 morts au , dont 46 en Allemagne et une en Suède[20]. Plus de 4 000 personnes ont été touchées dans douze pays[20], principalement des femmes d'un âge avancé[32].

Une psychose s'est installée en Allemagne à la suite des informations contradictoires sur les causes de cette épidémie[33].

Conséquences économiques et politiques modifier

Les ventes de légumes crus, notamment concombres, ont chuté en Europe début juin 2011 après sa mise en cause publique. Les pertes qui se chiffrent en millions d’euros (10 tonnes de concombres invendus ont, par exemple, été détruits dans une exploitation de Carquefou en Loire-Atlantique, le [34] et les producteurs espagnols évaluent leurs pertes à 225 millions d'euros par semaine), mais aussi du point de vue de la sécurité alimentaire, les commissaires européens chargés de l'Agriculture et de la Santé se sont réunis le [35]. Après avoir initialement annoncé une aide de 150 millions d'euros pour les producteurs de légumes, l'aide a été porté à 210 millions pour couvrir 70 % des pertes. L’Espagne réclame également une aide financière pour promouvoir ses légumes et ainsi regagner la confiance des consommateurs[36].

La gestion sanitaire par les autorités allemandes est largement critiquée, notamment à cause de l'organisation fédérale du pays qui relègue les problèmes de sécurité alimentaire au niveau des États-régions. La discrétion depuis le début de l'épidémie de la chancelière Angela Merkel et du ministre fédéral de la Santé Daniel Bahr nommé le , témoigne de cette faiblesse[37]. L’opposition réclame une cellule de crise centralisée[38].

Critiques et controverses modifier

Selon l'analyse d'André Gunthert, "l'affaire de la bactérie tueuse” révèle deux crises : celle du système d'alerte et celle du journalisme qui relaie « aveuglément les dépêches » sans vérification[39].

La filière bio a critiqué l'attitude des médias relayant abondamment le fait que ces graines germées étaient issues de l'agriculture biologique, information non pertinente car ce mode de production est soumis aux mêmes exigences en matière de sécurité sanitaire des aliments que l'agriculture conventionnelle[40].

Cette stigmatisation de l'agriculture biologique a notamment été véhiculée dans la presse par deux directeurs de recherche du CNRS, Francis-André Wollman et Jean-François Briat, qui ont publié une tribune dans le journal Libération[41], prétendant que les Centres pour le contrôle et la prévention des maladies (CDC) d'Atlanta auraient réalisé une étude en 1996 liant un tiers des décès dus à une souche pathogène d'E. coli à la consommation de produits biologiques. Ceci en se basant sur des affirmations d'Alan McHughen[42],[43], un scientifique canadien lié aux lobbies de l'agriculture conventionnelle[44], citant lui-même l'essayiste controversé Dennis Avery dans un de ses livres[42] et qui, bien que largement cité, est réfuté par le CDC lui-même qui affirme n'avoir jamais conduit une étude de la sorte[45].

Notes et références modifier

  1. ↑ Le Nouvel Observateur - AFP, « Fin de l'alerte au concombre espagnol », sur tempsreel.nouvelobs.com, (consulté le ).
  2. ↑ OMS, « Flambée de syndrome hémolytique et urémique en Allemagne »(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?), sur who.int (consulté le ).
  3. ↑ « Bactérie tueuse : les graines germées source de l'épidémie », sur Les Echos, (consulté le ).
  4. ↑ « E.coli: Rapid response in a crisis | European Food Safety Authority », sur web.archive.org, (consulté le ).
  5. ↑ Libération.fr, « “Crise du concombre” : l'origine de la contamination n'est toujours pas identifiée », Libération,‎ (lire en ligne, consulté le )
  6. ↑ France 24 et Sébastian Seibt, « L'agriculture touchée de plein fouet par la crise du concombre », France 24,‎ (lire en ligne, consulté le )
  7. ↑ « Bactérie : l'Union européenne dépourvue devant l'ampleur de la crise sanitaire »(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?), sur lesechos.fr (consulté le ).
  8. ↑ « La Russie se protège de la bactérie tueuse en fermant ses frontières à l'Europe », sur lexpress.fr (consulté le ).
  9. ↑ Ministère du travail, de l’emploi et de la santé, « Syndrome hémolytique et urémique (SHU) »(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?), sur sante.gouv.fr (consulté le ).
  10. ↑ « Allemagne: la plus grosse épidémie de syndrome hémolytique et urémique », sur ladepeche.fr (consulté le ).
  11. ↑ Yves Miserey, « Bactérie tueuse : la piste des germes de haricot »(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?), sur lefigaro.fr, .
  12. ↑ Journal Le Monde avec AFP et Reuters « Bactérie tueuse : les graines germées présumées coupables », 6 juin 2011 - 11 h 5
  13. ↑ « Bactérie tueuse : les graines germées hors de cause » www.lefigaro.fr/sante, le 6 juin 2011
  14. ↑ A.-L.B., « La bactérie tueuse a été retrouvée sur un concombre dans une poubelle en Allemagne », sur 20minutes.fr (consulté le ).
  15. ↑ « L'épidémie mortelle est due aux graines germées » www.lexpress.fr, 10 juin 2011.
  16. ↑ Karl de Meyer, « Bactérie tueuse : les graines germées source de l'épidémie » www.lesechos.fr, le 14 juin 2011.
  17. ↑ lemonde.fr et AFP, « La souche bactérienne a bien été identifiée, mais pas le canal de transmission », Le Monde,‎ (lire en ligne, consulté le )
  18. ↑ Production de Shiga-toxine Stx2 par les Escherichia coli entérohémorragiques: influence du génotype stx2
  19. ↑ Yonsei University College of Medicine sur ncbi.nlm.nih.gov
  20. ↑ a b et c Catherine Vincent, « Bactérie ECEH : la cause de l'épidémie reste mystérieuse », sur lemonde.fr, (consulté le ).
  21. ↑ Le Parisien, « Bactérie tueuse : il n'existe aucun traitement efficace », sur leparisien.fr (consulté le ).
  22. ↑ News Release University Southampton, « Study finds copper proves effective against new E. coli strains », sur soton.ac.uk (consulté le ).
  23. ↑ « Allemagne: Eceh dans un ruisseau », sur Le Figaro (consulté le ).
  24. ↑ [PDF] Surveillance sanitaire en Aquitaine, Point Hebdomadaire, Semaine 28 du 11/07/11 au 17/07/11 Rapport de l'INVS
  25. ↑ "E. coli" : la souche isolée en Gironde est "génétiquement apparentée" à la souche allemande sur LeMonde.fr
  26. ↑ Le Monde - le 08.06.2011 Les germes constituent un milieu très favorable au développement des bactéries
  27. ↑ Graines germées: la première crise de l'agriculture biologique
  28. ↑ Bactérie : les commerçants bio inquiets
  29. ↑ Communiqué de l'entreprise
  30. ↑ « E.Coli : les autorités disculpent la ferme bio », (consulté le ).
  31. ↑ (en-US) « New insight from whole-genome sequencing of Europe's 2011 E. coli outbreaks », sur phys.org (consulté le ).
  32. ↑ « Bactérie : Les femmes sont les plus touchées »(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?), sur francesoir.fr.
  33. ↑ « Bactérie tueuse : La psychose s'étend en Allemagne », Le Figaro,‎ (lire en ligne, consulté le )
  34. ↑ Dans le Parisien
  35. ↑ « Bactérie Eceh : la réunion des ministres européens de l'agriculture avancée à mardi », sur nouvelobs.com (consulté le ).
  36. ↑ Philippe Ricard et Frédéric Lemaître, « Bactérie tueuse : les pays européens dénoncent l'incapacité de l'Allemagne à gérer la crise sanitaire », Le Monde,‎
  37. ↑ Flora Genoux, « Bactérie : le fédéralisme allemand à l'épreuve de la gestion de crise », sur lemonde.fr (consulté le ).
  38. ↑ « En Allemagne, la gestion des autorités sanitaires critiquée »(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?), sur lesechos.fr (consulté le ).
  39. ↑ « La “bactérie tueuse”, laboratoire du journalisme de communication », sur culturevisuelle.org (consulté le ).
  40. ↑ « Graines germées : le Bio se rebiffe », sur planete.blogs.nouvelobs.com, .
  41. ↑ « La bactérie tueuse, la ferme biologique et l’opinion publique », sur liberation.fr, .
  42. ↑ a et b communiqué : « E. coli : les attaques récentes contre les produits bio reposaient sur… une étude qui n'existe pas ! » Biocontact, no 216, septembre 2011, p. 32.
  43. ↑ « E. coli : des attaques contre la bio infondées ! », sur fnab.org, .
  44. ↑ (en) « Profiles : Alan McHugen », sur lobbywatch.org.
  45. ↑ (en) Trevor Suslow; Department of Vegetable Crops, UCD, « Organic Produce Production and Food Safety », Perishables Handling Quarterly, no 98,‎

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